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牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的扩增与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵文娟 1 ; 田亮 2 ; 薄新文 1 ; 马勋 2 ; 康立超 1 ;

作者机构: 1.新疆农垦科学院新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室

2.石河子大学动物科技学院

关键词: 牦牛多杀性巴氏杆菌;外膜蛋白H;二级结构;B细胞抗原表位;功能预测

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2012 年 0 卷 01 期

页码: 139-144

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 旨在扩增牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的编码基因,并预测OmpH蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH在免疫保护中所起的作用。对牦牛多杀性巴氏杆菌的外膜蛋白OmpH基因进行PCR扩增及序列测定。应用生物信息学相关软件和方法,对牦牛多杀性巴氏杆菌OmpH蛋白的二级结构和B细胞抗原表位进行预测。牦牛多杀性巴氏杆菌OmpH基因全长1 478 bp,ORF包含1 002 bp编码333个氨基酸。二级结构以无规卷曲为主,有少量的α-螺旋和延伸带;推测OmpH蛋白有1个细胞黏附位点、2个糖基化位点。

  • 相关文献

[1]鹅多杀性巴氏杆菌OmpH的扩增与生物信息学分析. 赵文娟,康立超,田亮,薄新文,马勋. 2012

[2]生物信息学对扩展莫尼茨绦虫cDNA文库Cavβ基因分析与B细胞抗原表位预测. 赵文娟,康立超,王正荣,薄新文,王新华. 2012

[3]牛病毒性腹泻病毒结构蛋白基因的克隆及其B细胞抗原表位的预测. 何延华,黄新,薄新文,钟发刚,韩猛立,陈南颖,王新华. 2012

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