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不同遗传背景猪TNF-α基因启动子区多态性与其血清含量的关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李梦姝 1 ; 孙福亮 1 ; 柳俭强 1 ; 曹阳 1 ; 李兆华 1 ; 金海国 1 ; 张立春 1 ;

作者机构: 1.延边大学农学院;吉林省农业科学院

关键词: TNF-α基因;野杂猪;民猪;大白猪;基因多态性

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2019 年 01 期

页码: 69-73

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究不同遗传背景猪TNF-α基因启动子区多态性及其与血清含量的相关性,本实验采用克隆测序方法对3个不同遗传背景猪群体(长白山野猪民猪杂交猪,简称野杂猪、民猪和大白猪) TNF-α基因启动子区进行基因多态性检测并测序,选取特定区域采用高分辨率熔解曲线(HRM)方法分析其基因型,并分析了其不同基因型与血清TNF-α含量的相关性。测序结果显示3个群体猪TNF-α基因启动子区存在7个单核苷酸多态位点(SNP)。选取其G-1256、G-1239位点区采用HRM分析显示3个猪群体TNF-α基因启动子区存在4种基因型,其中CC基因型作为优势基因型,在野杂猪群体中该基因型频率高达73.0%,民猪次之为52.0%,大白猪最低为31.0%。差异显著性分析显示,野杂猪、大白猪群体中CC基因型个体血清TNF-α含量显著高于其它基因型个体(p<0.05)。将所有猪看做统一群体,差异显著分析显示CC基因型个体血清中TNF-α含量同样显著高于其它基因型个体(p<0.05)。转录因子结合位点预测显示CC基因型G-1239位点A构成NF-κB亚基RelB潜在转录结合位点。上述结果表明NF-κB信号通路在猪TNF-α基因转录表达调节中具有重要作用,本实验为研究影响猪群抗逆表型性状的调控通路奠定基础。

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