您好，欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库！
中国水产科学研究院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

传染性造血器官坏死病毒-Sn株基质蛋白基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐黎明 1 ; 刘洪柏 1 ; 卢彤岩 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词： 传染性造血器官坏死病毒-Sn株;基质蛋白;生物信息学分析

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2013 年 37 卷 09 期

页码： 1409-1415

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基质蛋白(matrix protein,M)是传染性造血器官坏死病毒(infectious haematopoieticnecrosis virus,IHNV)主要结构蛋白之一,是病毒感染后造成细胞凋亡的主要作用蛋白。为分析IHNV M蛋白的序列及结构特征,研究利用敏感细胞(EPC)培养传染性造血器官坏死病毒-Sn分离株(IHNV-Sn),根据M蛋白基因开放阅读框(open reading frame,ORF)的序列设计引物,利用RT-PCR的方法克隆得到M蛋白全长ORF,并且构建至表达载体pET27b(+)中,构建出pET27-M重组质粒。生物信息学分析结果显示,M蛋白基因的序列长度为588 bp,编码195个氨基酸残基,推导分子量约为21.88 ku,等电点为9.35;氨基酸序列分析表明,M蛋白富含丝氨酸、苏氨酸以及碱性氨基酸,存在丰富的α-螺旋、β折叠和无规则卷曲;M蛋白不含有信号肽;疏水性大于亲水性;没有跨膜区存在;抗原表位预测显示抗原性良好;结构预测显示,不存在N-糖基化位点,存在7个潜在的O-糖基化位点和15个潜在的磷酸化位点。系统进化树分析显示,IHNV-Sn株与美国分离株同为一簇。

  • 相关文献

[1]合浦珠母贝不同壳基质蛋白基因的表达水平比较. 薛桂英,郭奕惠,黄桂菊,范嗣刚,刘宝锁,喻达辉. 2013

[2]基于转录组测序探究乌鳢皮肤白化的分子机制. 李岩,周燕,雷骆,苏建,樊威,罗煜,李俊婷,高贺,周朝伟. 2022

[3]美丽硬仆骨舌鱼Raf激酶基因的克隆、组织表达及原核表达分析. 刘奕,杨叶欣,刘超,宋红梅,汪学杰,牟希东. 2021

[4]传染性造血器官坏死病毒-Sn1203株的基因型及糖蛋白的生物信息学分析. 徐黎明,刘红柏,尹家胜,卢彤岩. 2014

[5]传染性造血器官坏死病毒-Snl203株的基因型及糖蛋白的生物信息学分析. 徐黎明,刘红柏,尹家胜,卢彤岩. 2014

[6]锦鲤疱疹病毒丹东株ORF83基因克隆及生物信息学分析. 王世会,贾智英,李池陶,石连玉. 2017

[7]中华鳖Dkkl1基因的分子特征及对外源性激素处理的响应. 汪泳昌,祝骏贤,李建松,陈辰,纪利芹,洪孝友,刘晓莉,王亚坤,吴聪聪,余汶君,罗来福,陈海港,魏成清,朱新平,张俊杰,李伟. 2023

[8]双须骨舌鱼卵黄蛋白受体基因(vtgr)组织表达及生物信息学分析. 周康奇,潘贤辉,刘奕,牟希东,郑曙明,胡隐昌,宋红梅,杨叶欣. 2018

[9]草鱼Smad4基因的克隆、生物信息学分析及反义真核载体的构建. 吕池波,郁二蒙,谢骏,王广军,余德光. 2013

[10]海蜇(Rhopilema esculentum)even-skipped基因的克隆及生物信息学分析. 葛建龙,陈晓辉,陈立飞,刘长琳,边力,陈四清. 2021

[11]海带hsp70基因的克隆、分析及转录水平定量研究. 袁艳敏,刘福利,梁洲瑞,汪文俊,孙修涛,王飞久. 2018

[12]高温胁迫条件下大菱鲆肾脏转录组研究. 杨凯,黄智慧,马爱军,刘晓菲,杨双双. 2020

[13]斑节对虾金属硫蛋白全基因DNA克隆及生物学信息分析. 周发林,郑丽明,杨其彬,黄建华,杨丽诗,江世贵. 2017

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国水产科学研究院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台