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甘薯PHB基因家族的全基因组鉴定和表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 梅玉琴 1 ; 刘意 1 ; 王崇 2 ; 雷剑 2 ; 朱国鹏 1 ; 杨新笋 2 ;

作者机构： 1.海南大学园艺学院/海南省热带园艺作物品质调控重点实验室

2.湖北省农业科学院粮食作物研究所

关键词： 甘薯;PHB基因家族;系统进化;生物信息学;表达分析

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 1715-1725

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 蛋白质抑制素（prohibitin, PHB）是在原核生物到真核生物中发现的含有SPFH结构域的蛋白质。植物PHB基因家族参与多种不同生物过程的重要功能,包括生长发育以及对生物和非生物胁迫的响应。目前PHB蛋白在拟南芥、水稻、玉米、大豆、番茄和陆地棉等多种植物中被鉴定。但对甘薯中PHB家族的系统分析仍未确定。本研究鉴定出甘薯11个PHB基因,且对这些保守的蛋白质基序和基因结构的分析显示它们在系统发育亚群中具有高度的保守性。此外,启动子区域预测出与多种激素调节及胁迫相关的顺式作用元件,同时研究发现IbPHB基因在植物不同部位及受到不同的非生物胁迫时的表达模式存在差异。本研究系统分析了甘薯中IbPHB基因的一般特性,为甘薯及其他植物中PHB基因的功能特性研究提供了理论基础。

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