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杀鲑气单胞菌SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用

文献类型: 中文期刊

作者: 刘帅 1 ; 卢彤岩 2 ; 王荻 2 ; 曹永生 2 ; 贾钟贺 2 ; 王渊博 2 ; 李绍戊 3 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院;新疆额尔齐斯河流域开发工程建设管理局

2.;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院;新疆额尔齐斯河流域开发工程建设管理局

3.;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院;新疆额尔齐斯河流域开发工程建设管理局;

关键词: 杀鲑气单胞菌;fstA基因;SYBR-GreenⅠ;实时荧光定量PCR

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2017 年 07 期

页码: 2884-2891

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据GenBank中杀鲑气单胞菌铁载受体(ferric siderophore receptor,fst A)基因序列设计并合成一对特异性引物,经过反应体系优化后建立了检测杀鲑气单胞菌的SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。将fst A基因克隆到p MD18T载体上构建重组质粒pMD18T-fst A并制备标准曲线,结果显示该标准曲线的线性关系良好,扩增所得标准曲线为y=-4.255 2x+39.644,相关系数R2为0.988;熔解曲线分析显示产物为单一的特异峰。特异性检测结果表明,该方法对杀鲑气单胞菌及其亚种具有良好的特异性,与其他细菌不发生交叉反应;最低检测限为35拷贝/μL,较常规PCR的灵敏度高出约100倍。应用建立的方法对人工感染的虹鳟病样进行了检测,待检样品均呈阳性反应,表明该方法具有很好的适用性。研究表明,所建立的实时荧光定量PCR方法具有特异、灵敏、快速、定量的优点,可用于杀鲑气单胞菌的快速诊断及定量检测。

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