文献类型： 中文期刊
作者： 刘帅 1 ; 蒋丽 2 ;
作者机构： 1.上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心
2.中国水产科学研究院农业农村部水生动物基因组学重点实验室
关键词： 日本沼虾;全基因组关联分析;体重;出肉率
期刊名称： 安徽农业科学
ISSN： 0517-6611
年卷期： 2023 年 51 卷 002 期
页码： 108-110,114
摘要： [目的]定位筛选影响日本沼虾体重及出肉率性状的候选基因.[方法]收集成熟期且表现健康的日本沼虾,记录体重、出肉率,提取DNA进行测序并进行基因分型,获得单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphisms,SNP)标记数据,利用多性状联合的全基因关联分析(Genome-wide association study,GWAS)方法检验与体重、出肉率性状存在显著相关的SNP位点,根据SNP的物理信息实现候选功能基因的筛选和定位.[结果]联合分析共定位到6个SNP位点,检测效率远高于单一分析的1个SNP,根据6个显著位点共定位到5个候选功能基因,除1个功能未知的新基因外,剩余4个基因都与机体代谢、发育相关.[结论]完成了日本沼虾体重、出肉率性状相关基因的定位,可为日本沼虾生长代谢的基因组水平揭示提供理论基础,也可为日本沼虾的其他数量性状研究提供思路.
- 相关文献
[1]长江下游日本沼虾形态特征及主要性状对体重的影响. 刘凯,张敏莹,段金荣,徐东坡,王雯婷,施炜纲. 2011
[2]凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)形态性状与净肉重和出肉率的关系. 张倩,王全超,于洋,张成松,黄皓,李富花,相建海. 2018
[3]基于家系水平的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)保种群体出肉率与表型性状的相关性分析. 柴展,栾生,罗坤,孔杰,许圣钰. 2015
[4]尼罗罗非鱼出肉率与可量性状的相关性. 董在杰,梁政远,徐跑,明俊超,张平,张守领,何杰,谢庄. 2010
[5]日本沼虾SRAP反应体系正交设计及优化. 姚建华,傅洪拓,龚永生,吴滟,何新龙,李慧萍,乔慧. 2008
[6]鱼粉蛋白与发酵酶解豆粕蛋白不同配比对日本沼虾生长及免疫性能的影响. 丁志丽,张易祥,叶金云,周志金,杜震宇. 2015
[7]日本沼虾过氧化物还原酶基因的克隆及其表达分析. 孙盛明,戈贤平,傅洪拓,朱健,张世勇. 2014
[8]饲料糖脂比对日本沼虾生长性能及肝胰腺代谢酶活性、脂肪酸转运和Toll样受体通路相关基因表达的影响. 江婷琪,余王舒,赵小曼,任次成,谢鹏鹏,孔有琴,张易祥,叶金云,丁志丽. 2018
[9]日本沼虾中氨基脲含量检测方法的优化. 宋蓓,程波,宋怿,赵凤娇,王赛赛. 2018
[10]花生四烯酸对日本沼虾肝胰腺细胞脂质代谢基因表达的影响. 丁志丽,曹访,罗娜,孔有琴,张易祥. 2017
[11]露水草粉碎粒度和添加水平对日本沼虾生长性能、肝胰腺消化酶活性及非特异性免疫指标的影响. 张易祥,丁志丽,吴成龙,明建华,杨霞,邵仙萍,孔有琴,叶金云. 2018
[12]维生素E对日本沼虾生长性能、抗氧化性能及抗氨氮胁迫能力的影响. 孔有琴,丁志丽,张易祥,罗娜,叶金云. 2017
[13]日本沼虾(Macrobrachium nipponense)组蛋白酶B基因克隆及其在组织和卵巢发育过程中的表达. 赵卫红,陈立侨,王资生,张凤英,齐志涛. 2015
[14]共轭亚油酸对日本沼虾生长、抗氧化及脂质代谢的影响. 丁志丽,孔有琴,张易祥,杜震宇,罗娜,曹访,李景芬,叶金云. 2017
[15]饲料亚麻酸含量对日本沼虾生长、抗氧化能力、非特异性免疫性能及抗氨氮胁迫能力的影响. 罗娜,丁志丽,张易祥,孔有琴,吴成龙,姜志强,叶金云. 2017
[16]饥饿对日本沼虾生长和部分免疫功能的影响. 李志华,谢松,王军霞,陈大庆. 2007
[17]停乳链球菌对日本沼虾总超氧化物歧化酶活性的影响. 赵卫红,张凤英,於叶兵,王资生,齐志涛. 2015
[18]两种沼虾溶菌酶基因ORF的克隆和罗氏沼虾溶菌酶基因的组织表达(英文). 高风英,叶星,白俊杰,劳海华,吴锐全. 2005
[19]日本沼虾两种抗脂多糖因子的特性研究（英文）. 王英慧,修云吉,顾伟,孟庆国,王文. 2017
[20]饲料不同n-3/n-6脂肪酸比值对日本沼虾生长、虾体组分、血清抗氧化及相关基因表达的影响. 蒋振廷,刘波,戈贤平,周群兰,孙存鑫. 2019
作者其他论文 更多>>
-
采用期望最大化算法的半滑舌鳎性逆转性状高效遗传解析
作者：宋禹昕;常中宇;高进;赵云峰;杨润清;蒋丽
关键词：全基因组关联分析;半滑舌鳎;性逆转;主成分;期望最大化算法;广义线性模型
-
中短链脂肪酸甘油酯和乳酸杆菌对日本沼虾生长和免疫力的影响
作者：刘帅;蒋丽;杨博;熊贻伟;傅洪拓;刘波
关键词：日本沼虾;中短链脂肪酸;丁酸甘油酯;月桂酸单甘油酯;乳酸杆菌;免疫
-
虹鳟传染性胰脏坏死性状全基因组关联分析
作者：欧阳少琪;赵云峰;蒋丽;杨润清
关键词：虹鳟;胰脏;全基因组关联分析
-
简单回归尺度转换实现半滑舌鳎性逆转基因的高效定位
作者：黄岩;宋禹昕;蒋丽;杨润清
关键词：全基因组关联分析;半滑舌鳎;性逆转;主成分;尺度转换;简单回归模型;广义线性回归模型
-
半滑舌鳎有效群体大小估计
作者：王伟峰;崔瑜;蒋丽;王悦玲;王焕岭;李恒德
关键词：半滑舌鳎;简化基因组测序(2b-RAD);连锁不平衡;有效群体大小
-
近交对大菱鲆体尺性状生长的遗传影响
作者：宋宗诚;蒋丽;王丽娟;黄岩;杨润清
关键词：大菱鲆;近交;体尺生长;遗传效应;随机回归模型
-
虹鳟生长性状的随机回归分析
作者：王悦玲;谷伟;王炳谦;蒋丽;杨润清
关键词：虹鳟;生长性状;随机回归模型;遗传力;遗传相关
