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虹鳟传染性胰脏坏死性状全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 欧阳少琪 1 ; 赵云峰 2 ; 蒋丽 2 ; 杨润清 2 ;

作者机构： 1.上海海洋大学

2.中国水产科学研究院

关键词： 虹鳟;胰脏;全基因组关联分析

期刊名称： 山东农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-2324

年卷期： 2022 年 53 卷 004 期

页码： 618-623

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究虹鳟传染性胰脏坏死症(Infectious Pancreatic Necrosis,IPN)抗性的遗传基础,本文采用三种二歧性状的分析方法,对来自58个全同胞家族的749尾虹鳟(271尾抗性和478尾易感),注射传染性胰脏坏死病毒后的存活情况进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS).关联分析结果表明,共鉴定到两个QTN与虹鳟IPN抗性显著关联,位于四号染色体和对应的Scaffold上.以这些检测到的QTNs作为探针,对比虹鳟全基因组信息,筛选得到四个候选基因,它们可能是影响虹鳟IPN抗性的重要功能基因.通过对比三种方法的检测结果,得知GRAMMAR-Lambda法对检测二歧性状QTNs的统计能力略高于SAIGE和GMMAT法,具有更好的统计性能.这些研究结果为虹鳟抗传染性胰脏坏死病毒的遗传选育提供了分子标记,为虹鳟抗传染性胰脏坏死病毒的研究提供了理论基础.

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