文献类型： 中文期刊
作者： 程远 1 ; 郭勤卫 1 ; 郑佳秋 1 ; 万红建 2 ;
作者机构： 1.;苏州农业职业技术学院;浙江省植物有害生物防控重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地浙江省农业科学院蔬菜研究所;衢州市农业科学研究院;江苏沿海地区农业科学研究所
2.;苏州农业职业技术学院;浙江省植物有害生物防控重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地浙江省农业科学院蔬菜研究所;衢州市农业科学研究院;江苏沿海地区农业科学研究所;
关键词： 辣椒;紫色酸性磷酸酶;基因家族;生物信息学;表达分析
期刊名称： 浙江农业学报
ISSN： 1004-1524
年卷期： 2017 年 09 期
页码： 1498-1505
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatases,PAPs)属于金属磷酸酯酶家族,参与了植物大量的生理反应,特别是磷素的吸收与利用。本研究利用已经发表的辣椒基因组数据,采用同源比对方法对辣椒PAP基因家族进行鉴定与表达分析。通过鉴定发现辣椒基因组中至少含有25个PAP基因成员,氨基酸序列长度在264~639 aa,具有1~12个内含子,不均匀地分布在12条染色体上,仅发现1对基因以串联重复的形式存在。系统发育关系表明,辣椒、拟南芥和水稻PAP基因家族成员可以分为3个家族,8个亚家族,每个家族成员的数目是变异的,而且存在6对直系同源基因和20对旁系同源基因,这表明PAP基因家族的存在早于辣椒、拟南芥和水稻的分化。基于RNA-seq数据库和q RT-PCR方法,对辣椒PAP基因的组织表达及果实发育的不同时期进行分析,结果表明PAP家族基因具有组织表达特异性和发育时期表达特异性。
- 相关文献
[1]番茄WRKY转录因子in silico鉴定及表达分析. 万红建,俞锞,袁伟,刘云飞,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,杨悦俭. 2013
[2]红掌2个SOC1基因的克隆、序列与表达分析. 马广莹,朱开元,史小华,邹清成,刘慧春,詹菁,田丹青. 2017
[3]番茄查尔酮合成酶基因的鉴定及生物信息学分析. 阮美颖,万红建,叶青静,王荣青,姚祝平,周国治,俞锞,袁伟,刘云飞,杨悦俭. 2013
[4]参与辣椒素合成的DnaJ基因家族全表达谱分析. Fang Fanfei,Liu Fawan,Yang Xian,Wan Hongjian,Kang Yunyan,刘周斌. 2020
[5]辣椒DREB转录因子鉴定及其在涝害胁迫下的表达分析. 郑佳秋,王薇薇,梅燚,吴永成,万红建,潘宝贵,尤春,刘哲,沈峰,冯汝超. 2023
[6]辣椒蔗糖磷酸合成酶和磷酸蔗糖磷酸酶基因家族鉴定及表达. 柴松琳,钟洋敏,程远,阮美颖,王荣青,叶青静,姚祝平,周国治,庞欣,万红建. 2021
[7]萝卜(Raphanus sativus)Dof基因家族全基因组鉴定分析. 赵国富,魏庆镇,汪精磊,包崇来. 2019
[8]砂梨山梨醇转运蛋白(SOT)基因家族成员表达特性及在果实糖积累中的作用初探. 戴美松,徐飞,施泽彬,徐昌杰. 2015
[9]基于高通量测序的梨果实常用内参基因表达稳定性分析. 王月志,戴美松,蔡丹英,施泽彬. 2019
[10]大豆异黄酮还原酶基因的鉴定及生物信息学分析. 张古文,刘娜,冯志娟,徐盛春,胡齐赞,龚亚明. 2016
[11]绝食对家蚕血液蛋白的影响. ^A王永强^B1^D1%^A张平波^B2^D2%^A藤井博^B3^D2%^A麻生阳一^B4^D2%^A伴野丰^B5^D2%^A山本幸治^B6^D2. 2005
[12]擎天风梨泛素基因的克隆及生物信息学分析. 刘建新,沈福泉,张智,田丹青,葛亚英,沈晓岚,俞信英,王炜勇. 2009
[13]谷子HSP70基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 张古文,刘莉莉,王显瑞,柴晓娇,李书田. 2015
[14]兔病毒性出血症病毒基因组3′端非编码区的分子克隆及生物信息学分析. 刘光清,张玉颖,云涛,倪征,张淼涛,梁华丽,华炯刚,李双茂,杜青云,盛祖恬. 2006
[15]稻瘟病菌分泌蛋白组学研究. 崔书建,王教瑜,姜华,梁建生. 2018
[16]植物赤霉素氧化酶GA20ox基因的生物信息学分析. 张加强,刘慧春,周江华,谭晨,朱开元. 2019
[17]不同植物Mlo基因全基因组鉴定及系统进化分析. 史建磊,万红建,熊自立,张海利,马彦如,苏世闻,宰文珊. 2020
[18]番茄Hsp70基因鉴定及系统发育关系分析. 王荣青,万红建,李志邈,叶青静,阮美颖,周国治,姚祝平,杨悦俭. 2014
[19]番茄SBP基因家族的全基因组鉴定、结构特征及表达分析. 万红建,袁伟,俞锞,刘云飞,李志邈,叶青静,王荣青,阮美颖,周国治,姚祝平,杨悦俭. 2013
[20]鸭TLR2基因的克隆、序列分析及其结构预测. 李国勤,马永升,贾红敏,田勇,李进军. 2011
作者其他论文 更多>>
-
基于农艺性状的辣椒种质资源遗传多样性
作者：张婷;王雪艳;郭勤卫;李朝森;刘慧琴;项小敏;韦静;赵东风;万红建
关键词：辣椒;种质;农艺性状;遗传多样性
-
64份白辣椒种质资源的遗传多样性分析
作者：方萍萍;张婷;韦静;王雪艳;李朝森;刘慧琴;万红建;郭勤卫
关键词：白辣椒;Hyper-seq;SNP变异;遗传多样性;群体结构
-
加工型/鲜食型辣椒不同成熟期果实比较代谢组学分析
作者：高成安;万红建;叶青静;程远;刘晨旭;何勇
关键词：加工型辣椒;鲜食型辣椒;代谢物;比较代谢组;果实品质
-
腐植酸处理对樱桃番茄挥发性有机化合物成分和含量的影响
作者：关思慧;刘晨旭;姚祝平;万红建;刁明;程远
关键词：樱桃番茄;腐植酸;挥发性有机化合物;相对含量;风味特征
-
番茄液泡蔗糖转化酶抑制蛋白克隆、生物信息学及表达分析
作者：许洋;程远;阮美颖;王荣青;叶青静;姚祝平;周国治;刘乐承;万红建
关键词：液泡转化酶抑制蛋白;番茄;蔗糖代谢;表达
-
抗TYLCV口感型番茄新品种浙味2号的选育
作者：王荣青;周国治;阮美颖;叶青静;姚祝平;程远;万红建;李志邈
关键词：口感型番茄;浙味2号;一代杂种;抗TYLCV
-
蔗糖转化酶抑制蛋白研究进展
作者：杨月;程远;阮美颖;王荣青;叶青静;姚祝平;周国治;万红建
关键词：蔗糖转化酶抑制蛋白;植物器官;调控;生理功能
