您好,欢迎访问广东省农业科学院 机构知识库!

基于EST-SSR的广东与广西茶树资源遗传结构和遗传分化比较分析

文献类型: 中文期刊

作者: 乔小燕 1 ; 乔婷婷 2 ; 周炎花 2 ; 金基强 2 ; 马春雷 2 ; 姚明哲 2 ; 陈亮 2 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院茶叶研究所

2.中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心

关键词: 茶树;白毛茶;遗传多样性;遗传结构;遗传分化

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2011 年 44 卷 16 期

页码: 3297-3311

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】通过揭示茶树资源遗传多样性、遗传结构和遗传分化关系,为资源的有效保护和充分利用提供理论依据。【方法】利用109对核心EST-SSR标记对广东、广西的105份茶树核心资源进行遗传多样性和遗传分化比较分析;同时对广东和广西资源组群间、组群内白毛茶和茶种群间、种群内进行AMOVA分子方差分析,进一步剖析遗传结构,并绘制群体遗传结构图。【结果】109对核心EST-SSR标记共检测到435个等位基因,平均等位基因(NA)3.99个,平均有效等位基因(NE)为2.12,平均Nei's基因多样性(H)为0.59,平均观测杂合度(Ho)为0.32,平均期望杂合度(He)为0.46,平均多态性信息含量(PIC)为0.56。广东茶树资源遗传多样性的上述6个参数均小于广西茶树资源。广东白毛茶NA和H低于广东茶,NE、He、Ho和PIC与茶较为接近;广西白毛茶NA大于广西茶,但是NE、He和H低于茶。F-统计量分析表明白毛茶与茶种群内近交系数(Fis)、种群间近交系数(Fit)和种群遗传分化(Fst)都较低,基因流(Nm)都较高。广东白毛茶与广西白毛茶Fst为0.04,基因交流相对较低为6.26。AMOVA分析显示组群间遗传变异为3.09%,组群内种群间遗传变异为2.22%,种群内遗传变异为94.69%。群体遗传结构显示105份茶树资源可分为3个类群,类群Ⅰ由6份选育品种组成;类群Ⅱ由43份广东资源和16份广西资源组成;类群Ⅲ包括广西36份和广东4份资源。【结论】广东茶树资源遗传多样性程度低于广西。广东白毛茶遗传多样性比广东茶丰富,种群遗传分化低,存在较频繁的基因交流。广东白毛茶遗传多样性低于广西白毛茶,遗传分化相对较高,基因流较低。AMOVA分析显示遗传变异主要分布于广东、广西茶树资源群体内。

  • 相关文献

[1]广东仁化白毛茶优异株系遗传多样性的EST-SSR分析. 乔小燕,吴华玲,陈栋,李家贤,黄华林,晏嫦妤,何玉媚. 2010

[2]广东高州7个普通野生稻居群遗传结构的SSR分析. 陈雨,潘大建,曲延英,范芝兰,陈建酉,李晨. 2008

[3]广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析. 周炎花,乔小燕,马春雷,乔婷婷,金基强,姚明哲,陈亮. 2011

[4]基于线粒体COⅠ基因的荔枝蒂蛀虫种群遗传多样性分析. 常虹,高燕,王思威,王潇楠,刘艳萍. 2023

[5]用SSR标记分析高州野生稻的遗传多样性. 李晨,潘大建,毛兴学,涂从勇,周汉钦,范芝兰,李晓方. 2006

[6]汝城白毛茶与两广主要“白毛茶”居群亲缘关系的RAPD分析. 黎星辉,施兆鹏,刘春林,罗军武,沈程文,李家贤,方华春. 2002

[7]43份茶树品种资源遗传多样性的SSR研究. 谭月萍,李娟,刘硕谦,晏嫦妤,陈金华. 2009

[8]云南白莺山茶树种质资源遗传多样性及群体结构分析. 姜晓辉,李红建,李崇兴,陈栋,方开星,秦丹丹,吴华玲. 2019

[9]基于表型参数及SRAP标记的广东茶树种质遗传多样性. 沈程文,宁正祥,黄建安,陈栋,李家贤. 2009

[10]利用SRAP和ISSR标记分析广东茶树种质资源的遗传多样性. 沈程文,黄建安,赵世浩,宁正祥,李家贤,赵超艺,陈栋. 2010

[11]基于SSR标记的55份清远野生茶树种质资源遗传多样性和亲缘关系分析. 穆小婷,廖侦成,凌彩金,郑溪,林建勇,何建平,江丽冰. 2023

[12]凤凰单丛古茶树资源的遗传多样性AFLP分析. 萧力争,晏嫦妤,李家贤,罗军武,何玉媚,赵超艺. 2007

[13]茶树品种资源遗传多样性的AFLP研究. 黄建安,李家贤,黄意欢,罗军武,龚志华,刘仲华. 2006

[14]不同产地瓠瓜品种ITS序列的遗传多样性分析. 赵芹,谢大森,彭庆务,罗少波,郭巨先,邓沙沙. 2014

[15]广东省稻区越冬代大螟种群动态监测及遗传多态性差异分析. 吴阳刚,袁龙宇,黄德超,李燕芳,肖汉祥,张振飞. 2023

[16]柚类品种遗传相互关系的RAPD标记研究. 张太平,彭少麟,王峥峰,凌定厚,甘廉生. 2001

[17]基于SLAF标签测序分析广东省栽培稻种质资源的遗传结构及演化关系. 孙炳蕊,潘大建,李晨,江立群,张静,吕树伟,刘清,毛兴学,陈文丰,范芝兰. 2022

[18]高氨基酸和高茶氨酸茶树资源筛选. 方开星,姜晓辉,秦丹丹,李红建,黄华林,潘晨东,李波,吴华玲. 2019

[19]茶树种质异地保存及繁育实用技术. 方开星,李波,吴华玲. 2021

[20]英红九号茶园机械化采摘关键技术研究. 赖幸菲,赖兆祥,操君喜,陈海强,吴华玲,周波,黎秋华,孙世利. 2020

作者其他论文 更多>>