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不同大菱鲆(Scophthalmus maximus)个体肠道菌群结构差异研究

文献类型: 中文期刊

作者: 邢孟欣 1 ; 李贵阳 2 ; 侯战辉 1 ; 曲艳梅 1 ; 刘斌 1 ;

作者机构: 1.中国科学院海洋研究所

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词: 大菱鲆;肠道微生物;16SrRNA;RFLP

期刊名称: 现代生物医学进展

ISSN: 1673-6273

年卷期: 2014 年 14 卷 20 期

页码: 3801-3805

摘要: 目的:肠道微生物能够帮助宿主完成多种生理生化功能,对宿主的健康生长也起到非常重要的作用。大菱鲆(Scophthalmus maximus)是我国北方最重要的海水养殖品种之一。然而,细菌性疾病的频发造成大规模的鱼类死亡。此外,许多大菱鲆致病菌也被证实是人类潜在的致病菌。因此鉴定成年养殖大菱鲆肠道中所包含的核心菌群,并筛选可能与大菱鲆或人类健康密切相关的细菌尤为重要。方法:构建三个大菱鲆个体肠道16S rRNA文库,利用限制性片段长度多态性分析(RFLP)及生物信息学技术研究三个大菱鲆个体肠道菌群结构及多样性。结果:共得到758个阳性克隆,16个OTU类型。分类分析显示,变形菌门在大菱鲆肠道中占优势地位。进一步将细菌按属来分类显示,弧菌属所占的比例最高,约为95.3%。韦恩图显示大菱鲆三个个体共有的OTU类型数量为3,分别占三个大菱鲆个体肠道文库中阳性克隆总数的94.9%、96.7%以及93.5%。分类结果显示它们分别属于条件致病菌哈氏弧菌、副溶血弧菌和创伤弧菌。结论:大菱鲆的核心肠道菌群为弧菌属,它的主要成员哈氏弧菌、副溶血弧菌和创伤弧菌对大菱鲆及人类的健康起到关键的作用。在水产养殖过程中,通过监控这些弧菌种类的浓度变化能够及时对养殖环境进行评价,并及时调整温度、水质等因素,这为预防大菱鲆细菌性疾病,保证人类健康提供重要的理论依据。

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