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一株鹅细小病毒全基因特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 万春和 1 ; 朱海侠 1 ; 黄瑜 1 ; 彭春香 1 ; 程龙飞 1 ; 施少华 1 ; 傅光华 1 ; 陈红梅 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 鹅细小病毒;全基因;分子特征

期刊名称: 中国动物传染病学报

ISSN: 1674-6422

年卷期: 2011 年 19 卷 04 期

页码: 19-24

摘要: 根据GenBank登录的鹅细小病毒基因序列和基因组结构特征,采用PCR技术扩增获得一株鹅细小病毒株(Goose parvovirus,GoPV)全基因序列,为中国大陆地区首次报道。GoPV株病毒全基因大小为5106 nt,其基因组5'端和3'端均含有相同的末端倒置重复序列(inverted terminal repeats,ITR),ITR全长为444 nt。GoPV基因组主要由左右两侧两个开放阅读框组成,左侧编码非结构蛋白(non-structure protein,NS)NS1和NS2,右侧编码3种结构蛋白(viral structural protein,VP)VP1、VP2和VP3。NS基因全长为1884 nt(537~2420 nt),其中NS2全长1356 nt(1065~2420 nt);VP基因全长2199nt(2439~4637 nt),其中VP2全长1764 nt(2874~4637 nt),VP3全长1605 nt(3033~4637nt),在其右侧的ITR前有一个Poly(A)的尾。GoPV株病毒全基因和欧洲疫苗株(EU583392(VG32/1,Europe))核苷酸同源性最高,高达98.6%。本研究为进一步研究GPV分类地位以及进化关系提供依据,也为研究GPV强毒株和疫苗株之间生物学特性以及GPV治病机理和开发基因工程疫苗奠定基础。

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