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12个辣椒microRNA的靶标预测及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孟纯阳 1 ; 魏小春 2 ; 赵艳艳 2 ; 原玉香 2 ; 杨双娟 2 ; 王志勇 2 ; 张晓伟 2 ; 郑直 2 ; 姚秋菊 2 ; 张强 3 ;

作者机构： 1.河南省农业科学院园艺研究所;郑州大学生命科学学院生物工程系

2.;河南省农业科学院园艺研究所;郑州大学生命科学学院生物工程系

3.;河南省农业科学院园艺研究所;郑州大学生命科学学院生物工程系;

关键词： 辣椒;microRNA;靶标;胁迫;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 12 期

页码： 3820-3829

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探索12个辣椒microRNA的时空表达及胁迫响应。根据辣椒中已鉴定和注释的microRNA信息,进行靶标预测和时空表达分析。靶标除转录因子外,还有ABC transporter、WD40和锌指结构等。辣椒中miRNA表达具有组织特异性,并且miRNA在果实发育中也起作用。同时,对辣椒进行脱落酸、茉莉酸甲酯、高温、低温、盐和辣椒疫病病原菌处理。采用实时荧光定量PCR检测12个miRNA在不同处理下的表达情况。结果发现micro RNA对胁迫有响应,对胁迫呈现出显著性表达差异,miR4414b受疫病胁迫上调表达,miR167在脱落酸胁迫下下调表达,miR396d经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病诱导后,显著上调表达。miR156在高温和低温胁迫下下调,靶标转录因子SBP可能上调,适应胁迫反应。但miR156a经NaCl诱导后显著上调表达,可能导致靶标下调表达。miR171c经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病处理显著下调,靶标GRAS基因可能上调抵抗胁迫,本研究对辣椒中miRNA的进一步研究提供帮助。

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