文献类型: 中文期刊
作者: 傅明骏 1 ; 吴松 1 ; 唐蕾 1 ; 周发林 1 ; 邱丽华 1 ; 江世贵 1 ;
作者机构: 1.中国水产科学研究院南海水产研究所/农业部南海渔业资源开发利用重点实验室
关键词: 斑节对虾;泛素融合蛋白L40;卵巢发育;基因克隆
期刊名称: 广东农业科学
ISSN: 1004-874X
年卷期: 2016 年 43 卷 04 期
页码: 144-150
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 从斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组数据中筛选获得泛素融合蛋白Ub L40基因(ubiquitin/ribosomal L40 fusion protein,Pm Ub L40)的部分序列,利用RACE技术克隆其c DNA全长序列,通过生物信息学进行结构分析;利用实时定量PCR技术检测该基因在斑节对虾不同组织及卵巢不同发育期的表达情况。结果表明,Pm Ub L40基因c DNA全长571 bp,开放阅读框(Open reading frame,ORF)长390 bp,编码129个氨基酸,预测分子量约14.7 ku,理论等电点为9.76。预测氨基酸序列的N-末端(1~76aa)为高度保守的泛素结构域,C-末端(77~129aa)为典型的核糖体蛋白L40结构域。多重序列比对表明不同物种的Ub L40在进化过程中高度保守。实时定量PCR结果显示Pm Ub L40基因在肝胰腺的表达量最高,肌肉、卵巢次之,其他组织的表达较低;在卵巢发育过程中Pm Ub L40基因在II期表达最高,其次是V期,显著高于I、III、IV期。研究结果表明Pm Ub L40基因在斑节对虾卵巢发育过程中可能具有重要作用。
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