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猕猴桃CHI密码子偏好性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李崇高 1 ; 冯新 2 ; 高敏霞 2 ; 钟春水 2 ; 陈文光 2 ; 刘萍元 2 ; 陈义挺 3 ;

作者机构: 1.福建省建宁县农业局;福建省农业科学院果树研究所;福建农林大学园艺学院

2.;福建省建宁县农业局;福建省农业科学院果树研究所;福建农林大学园艺学院

3.;福建省建宁县农业局;福建省农业科学院果树研究所;福建农林大学园艺学院;

关键词: 猕猴桃;查尔酮异构酶;密码子;偏好性

期刊名称: 东南园艺

ISSN: 2095-5774

年卷期: 2016 年 05 期

页码: 26-31

摘要: 试验以GenBank登录的猕猴桃查尔酮异构酶基因CHI为基础,采用CodonW分析其偏好性,并分别与模式生物基因组进行比较。研究结果发现,猕猴桃CHI有效密码子数为55.93,密码子GG含量和第3位G\C含量分别为0.483和0.525,偏好性较强的密码子有29个,其中AAC、ACC、AGG、CCT和TCT具有极强的偏好性;此外,猕猴桃CHI与模式生物基因组均保持较大的偏好性差异。研究认为,猕猴桃CHI密码子整体偏好性较弱,但对部分特定密码子仍存在选择偏好。研究结果为猕猴桃CHI基因后续研究提供了科学依据。

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