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甘薯长喙壳菌果胶酸裂解酶基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张成玲 1 ; 孙厚俊 1 ; 唐伟 1 ; 马居奎 1 ; 杨冬静 1 ; 陈晶伟 1 ; 罗勤川 1 ; 刘亚菊 1 ; 谢逸萍 1 ;

作者机构： 1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院甘薯研究所/农业农村部甘薯生物学与遗传育种重点实验室

关键词： 甘薯长喙壳菌;果胶酸裂解酶;克隆;生物信息学

期刊名称： 江苏师范大学学报(自然科学版)

ISSN： 2095-4298

年卷期： 2021 年 004 期

页码： 24-28

摘要： 由甘薯长喙壳菌（Ceratocystis fimbriata）引起的甘薯黑斑病是甘薯重要的病害之一,但其致病机制尚不明确.根据已有的甘薯长喙壳菌全基因组序列,以山东潍坊样品中分离到的菌株SD为模板,扩增病菌重要致病因子果胶酸裂解酶基因CfPL,并对蛋白分子质量、理论等电点、跨膜区、亲疏水性、磷酸化位点等理化性质进行分析.结果表明,CfPL基因开放阅读框长度为1 551bp,编码516个氨基酸,蛋白分子质量为52.5kD,理论等电点为4.87,为稳定的亲水性蛋白.蛋白定位在细胞外,无跨膜结构和糖基化位点,含有92个磷酸化位点、1个信号肽,属于果胶裂解酶C类家族成员.对CfPL基因克隆及相关生物学特性的分析,可为进一步阐明其基因功能和病菌致病机理提供参考.

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