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大豆GmNCED5基因非生物胁迫响应及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 朱琨 1 ; 翟莹 1 ; 于海伟 1 ; 张军 2 ; 邱爽 1 ; 何佳琦 1 ; 李铭杨 1 ;

作者机构: 1.齐齐哈尔大学生命科学与农林学院

2.黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院

关键词: 大豆;GmNCED5;非生物胁迫;表达分析;生物信息学分析;顺式作用元件

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2021 年 40 卷 004 期

页码: 476-481,489

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究大豆9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因GmNCED5对非生物胁迫的响应及原理,为植物基因工程及大豆抗逆育种提供理论基础,本研究检测GmNCED5在非生物胁迫下的表达量,并对该基因及其启动子序列进行生物信息学分析.实时荧光定量PCR结果显示,干旱、高盐、高温、低温及外源脱落酸(ABA)处理均可以不同程度地诱导GmNCED5在大豆幼苗中表达.GmNCED5基因开放阅读框(ORF)全长1 686 bp,编码561个氨基酸.亚细胞定位预测结果显示,GmNCED5蛋白主要定位于细胞质中.系统进化分析表明GmNCED5蛋白与豇豆VuNCED蛋白的亲缘关系最近.启动子预测分析结果显示,GmNCED5启动子区域含有5种激素响应相关顺式作用元件和3种胁迫响应相关顺式作用元件.由此推测GmNCED5可能通过启动子区域的顺式作用元件响应非生物胁迫.

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