文献类型： 中文期刊

作者： 张军 ¹ ; 高海娟 ¹ ; 孙蕊 ¹ ; 王若丁 ¹ ; 李伟 ¹ ; 王晓龙 ¹ ; 李莎莎 ¹ ; 柴华 ¹ ; 杨曌 ¹ ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院

关键词： 紫花苜蓿;盐碱胁迫;GEO数据库;生物信息学

期刊名称： 现代畜牧科技

ISSN： 2095-9737

年卷期： 2025 年 009 期

页码： 12-16

摘要： 为筛选盐碱胁迫下紫花苜蓿核心差异表达基因和相关的代谢通路。通过检索GEO数据库中与紫花苜蓿盐碱胁迫相关的芯片数据集，并利用GEO中的GEO2R工具筛选差异基因，然后利用DAVID数据库对筛选后的差异表达基因进行GO富集和KEGG富集注释，再结合STRING数据库对差异表达基因构建蛋白质互作关系网络图。研究结果表明，确定芯片GSE13921中的6个样本GSM350627、GSM350628、GSM350629和GSM350640、GSM350642、GSM350646样本为研究对象，筛选出9 787个差异表达基因，其中4 947个上调差异表达基因，4 840个下调差异表达基因；通过DAVID在线功能富集分析可知，盐碱胁迫主要对紫花苜蓿体内的蛋白质磷酸化、过氧化氢分解过程、跨膜运输、碳水化合物的代谢过程，以及黄酮类化合物生物合成和苯丙烷类生物合成等途径有显著影响。该研究结果以期为研究紫花苜蓿抗盐碱机理提供一定的理论依据。