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鲫体重和体厚相关的EST-SSRs标记筛选及同源基因分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郭薇 1 ; 郑先虎 2 ; 匡友谊 2 ; 崔晓亮 2 ; 曹顶臣 2 ; 孙效文 1 ;

作者机构: 1.哈尔滨师范大学生命科学与技术学院

2.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词: 鲫(Carassius auratus);EST-SSRs;体重;体厚;同源比对

期刊名称: 淡水渔业

ISSN: 1000-6907

年卷期: 2013 年 43 卷 02 期

页码: 11-17

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用300个EST-SSRs标记对普通二倍体鲫(Carassius auratus)自交F2代的181个个体进行基因型检测,并对其体重、体厚两种经济性状进行单标记回归分析。Permutation检验(10 000次)结果显示,38个标记与所检测的经济性状相关,其中26个标记达到显著性相关(P<0.05),12个标记达到极显著性相关(P<0.01)。在38个相关标记中,有27个标记与体重相关,25个标记与体厚相关,14个标记与体重、体厚均相关。对同一标记的不同基因型之间进行多重比较,找到了与两种经济性状相关的基因型。将与性状相关的38个标记与斑马鱼(Da-nio rerio)基因组序列进行BLAST同源性比对,找到10条相似性高且功能已知的EST-SSRs序列(E

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