文献类型： 中文期刊

作者： 向旭 ¹ ; 欧良喜 ¹ ; 陈厚彬 ² ; 孙清明 ¹ ; 陈洁珍 ¹ ; 蔡长河 ¹ ; 白丽军 ¹ ; 赵俊生 ¹ ;

作者机构： 1.广东省农业科学院果树研究所

2.华南农业大学园艺学院

关键词： 荔枝;EST-SSR;种质资源;遗传多样性

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2010 年 29 卷 06 期

页码： 1082-1092

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据本实验室已获得的荔枝果皮cDNA文库EST序列,通过SSRIT在线检索,从3391条EST序列中,发现305条含有SSR,占整个文库EST的8.99%。利用SSR-ESTs序列共设计100对EST-SSR引物,其中62对在荔枝上有扩增产物,50对有扩增多态性,即具有一定的通用性。接着从96份荔枝种质中选取12个品种的基因组DNA,开展核心引物筛选,共筛选出多态性较好的EST-SSR分子标记30个;这30个EST-SSR分子标记在96份资源共扩出284条带,不同引物的扩增条带在3～18条之间,平均9.47条,其中有282条为多态性带,多态率高达99.30%,每对引物的Nei's基因多样度范围为0.186～0.396,香农信息指数范围为0.318～0.558;此外,系统聚类分析结果表明,在相似系数0.5525处,可将96份荔枝种质资源分成了8大类群,该8大类群基本与其生态类型和植物学性状特征相符。在此基础上,还对荔枝的主栽品种和特殊种质进行鉴别,结果表明,该30个EST-SSR分子标记在不同品种间可产生较清晰可辨的多态性差异,为荔枝品种以及种质资源鉴别和鉴定的分子指纹的构建奠定了良好基础。