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荔枝VQ基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应

文献类型： 中文期刊

作者： 凡超 1 ; 杨杰 1 ; 陈蓉 1 ; 刘伟 1 ; 向旭 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院果树研究所

关键词： 荔枝;VQ基因家族;生物信息学;非生物胁迫;表达分析

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 739-750

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】VQ蛋白是一类含有保守VQ基序（FxxhVQxhTG）的植物特异性蛋白，在植物生长发育和非生物胁迫应答中发挥重要作用。研究鉴定了荔枝VQ基因家族，并分析其在不同组织的表达模式及在低温、高温、干旱和盐胁迫下的应答，为后续研究其抗逆机制奠定了基础。【方法】用生物信息学方法在荔枝全基因组中鉴定LcVQ基因，并对其理化性质、亚细胞定位、基因结构和保守基序等进行分析；用MEGA 6.0软件构建系统发育树，分析荔枝、拟南芥和水稻VQ蛋白的系统发育关系；用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术验证LcVQs对多种非生物胁迫的响应情况。【结果】荔枝中共鉴定获得可聚类为9个亚族的18个VQ基因（LcVQ1-18）,依次分布在荔枝的11条染色体上，其编码蛋白的氨基酸数介于111～427之间，分子质量为12.48～45.49 kD;除LcVQ15和LcVQ17定位于细胞质之外，其余LcVQ蛋白均定位于细胞核。LcVQs启动子区域包含大量植物生长发育响应元件、激素响应元件及逆境响应元件。LcVQs的表达量在不同组织中具有明显差异，总体上分为普遍性表达和特异性表达。LcVQs可快速响应非生物胁迫，在低温、高温、干旱和盐胁迫处理3 h内分别有4,3,3,4个LcVQs明显上调表达。【结论】荔枝全基因组中有18个VQ家族成员，具有典型VQ保守结构域，能差异化响应多种非生物胁迫。

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