文献类型： 中文期刊

作者： 凡超 ¹ ; 杨杰 ¹ ; 陈蓉 ¹ ; 刘伟 ¹ ; 向旭 ¹ ;

作者机构： 1.广东省农业科学院果树研究所农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省热带亚热带果树研究重点实验室

关键词： 荔枝;HSP70基因家族;生物信息学;表达分析

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 1102-1119

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： HSP70蛋白作为热激蛋白（heat shock protein,HSP）家族重要成员之一，在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥着重要作用。为探究荔枝（Litchi chinensis） HSP70基因家族成员在应对低温、高温、干旱及盐胁迫环境时的作用，利用生物信息学方法鉴定荔枝全基因组中的HSP70基因家族，并通过实时荧光定量PCR （quantitative real-time PCR, q RT-PCR）技术检测HSP70家族成员在不同非生物胁迫处理下的表达模式。结果显示，Lc HSP70基因家族共包含18个成员，不均匀地分布在荔枝的10条染色体上，其蛋白包含479-851个不等的氨基酸，等电点介于5.07-6.95之间，分子质量为52.44-94.07 k Da。Lc HSP70蛋白在细胞核、细胞质、内质网、线粒体和叶绿体中有分布。系统进化分析发现Lc HSP70蛋白分布在5个亚族，分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅵ亚族。Lc HSP70s启动子区域拥有多种与植物生长发育、激素响应及逆境响应相关的顺式作用元件。转录组数据分析显示，Lc HSP70s存在明显的组织表达特异性，总体上可分为普遍性表达和特异性表达。非生物胁迫表达分析显示，该基因家族成员均可以对低温、高温、干旱和盐胁迫作出不同程度的反应，且在不同时间表达差异显著。上述研究结果为进一步探究荔枝HSP70基因家族的功能奠定了基础。