您好,欢迎访问河南省农业科学院 机构知识库!

乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体轴中miRNA表达谱比较分析

文献类型: 中文期刊

作者: 任巧玲 1 ; 张家庆 1 ; 王璟 1 ; 陈俊峰 1 ; 马强 1 ; 高彬文 1 ; 刘付玖 1 ; 邢宝松 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院畜牧兽医研究所河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室

关键词: miRNA;乏情;发情;初产母猪;下丘脑-垂体轴

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN:

年卷期: 2023 年 011 期

页码: 4491-4503

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】从神经内分泌系统揭示微小RNA(microRNA,miRNA)调控初产母猪情期活动的遗传机制。【方法】利用RNA-Seq技术对乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体轴中的small RNA进行测序,获得了母猪下丘脑和垂体miRNA表达谱,并对筛选的差异表达miRNA进行GO和KEGG等功能分析。【结果】从所构建的4个文库中共鉴定出1 096个miRNAs,其中已知miRNAs 364个,新预测miRNAs 732个。以发情母猪为对照,在乏情母猪的下丘脑有16个miRNAs存在差异表达,其中6个上调,10个下调;在乏情母猪垂体有9个miRNAs存在差异表达,其中2个上调,7个下调。下丘脑中16个差异表达miRNAs共预测到5 212个靶基因,垂体中9个差异表达miRNAs共预测到6 897个靶基因。下丘脑中靶基因主要在细胞投射组装、质膜结合的细胞投射组装、神经元投射发育的负调控、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性等GO条目及Ras信号通路、神经营养因子信号通路、ErbB信号通路、mTOR信号通路等KEGG信号通路中显著富集;垂体中靶基因主要在mRNA加工调控、Ras GTP酶结合、泛素样蛋白连接结酶活性、表皮生长因子受体结合等GO条目及蛋白激酶、鞘脂类信号通路、凋亡、ErbB信号通路、NF-κB信号通路等KEGG信号通路中显著富集。从构建的差异表达miRNAs与生殖相关功能靶基因的调控网络中,筛选的Chr3_8404_mature、ssc-miR-9和ssc-miR-34c可能在下丘脑-垂体轴中对初产母猪情期活动的调控起重要作用。下丘脑和垂体各选4个差异表达miRNAs进行实时荧光定量PCR验证,其表达趋势与测序结果基本一致。【结论】本研究成功构建了乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体轴miRNA的表达谱,并对差异表达miRNA的功能进行了深度挖掘,筛选到了3个对初产母猪情期活动起重要作用的miRNAs,为初产母猪情期活动遗传机制的解析提供了miRNAs方面的理论依据。

  • 相关文献

[1]乏情和发情初产母猪卵巢microRNA差异表达分析. 任巧玲,白献晓,王璟,郭红霞,陈俊峰,马文涛,和小娥,张家庆,邢宝松. 2018

[2]乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体-卵巢轴中lincRNAs表达谱比较分析. 任巧玲,张家庆,陆东锋,王璟,陈俊峰,马强,白献晓,郭红霞,高彬文,邢宝松. 2020

[3]发情和乏情初产母猪下丘脑-垂体-卵巢轴差异表达基因筛选及分析. 任巧玲,张家庆,郭红霞,王献伟,王璟,吕玲燕,陈俊峰,马强,张彬,邢宝松,徐泽君. 2021

[4]玉米雌穗发育杂种优势相关miRNA的研究. 王琪月,孟淑君,张柯,张战辉,汤继华,丁冬. 2018

[5]胚胎移植前供体牛与受体牛血浆外泌体miRNA差异表达分析. 翟亚莹,施巧婷,楚秋霞,朱肖亭,滑留帅,张子敬,陈付英,祁兴磊,王二耀,吕世杰. 2022

[6]马立克病病毒编码的mi R-M4-5 p调控宿主靶基因的筛选及鉴定. 苏芮,滕蔓,李会珍,郑鹿平,刘豪丽,刘金玲,朱志坚,罗俊,张改平. 2020

[7]miRNA在奶牛子宫内膜炎治疗靶点的研究进展. 张志浩,张子敬,吕世杰,朱肖亭,李欣淼,张格阳,闵佳,屈俊峰,黄永震,施巧婷,王二耀,PENG Sheng-kun. 2024

[8]马立克氏病病毒编码的microRNA:从基因组学到功能研究. 罗俊,滕蔓,樊剑鸣,王方雨,周玲,邓瑞广,张改平. 2010

[9]利用Solexa测序技术鉴定甜橙miRNAs. 王永江,李中安,张振臣,杨方云,周彦. 2013

[10]马立克氏病病毒编码的miR-M12-5p对鸡HVCN1基因表达的靶向调控. 李会珍,滕蔓,党露,冯丽丽,马圣明,赵朴,罗俊,张改平. 2016

[11]Putative roles as oncogene or tumour suppressor of the Mid-clustered microRNAs in Gallid alphaherpesvirus 2 (GaHV2) induced Marek's disease lymphomagenesis. Teng, Man,Wu, Zi-Xiang,Wu, Run,Teng, Man,Zhao, Pu,Dang, Lu,Li, Hui-Zhen,Ma, Sheng-Ming,Luo, Jun,Yu, Zu-Hua,Ma, Sheng-Ming,Luo, Jun,Zhuang, Guo-Qing,Cui, Zhi-Zhong,Zhang, Gai-Ping,Zhang, Gai-Ping.

[12]Small RNA and Degradome Deep Sequencing Reveals Peanut MicroRNA Roles in Response to Pathogen Infection. Zhao, Chuanzhi,Xia, Han,Zhao, Shuzhen,Hou, Lei,Zhang, Ye,Li, Changsheng,Wang, Xingjun,Zhao, Chuanzhi,Xia, Han,Zhao, Shuzhen,Hou, Lei,Zhang, Ye,Li, Changsheng,Wang, Xingjun,Cao, Tingjie,Zhang, Xinyou,Yang, Yu.

[13]Marek's disease virus-encoded microRNAs: genomics, expression and function. Luo Jun,Teng Man,Fan JianMing,Wang FangYu,Zhou Ling,Deng RuiGuang,Zhang GaiPing,Fan JianMing. 2010

作者其他论文 更多>>