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香蕉α-淀粉酶基因家族的系统进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 董晨 1 ; 贾利强 1 ; 决登伟 1 ; 赵秋芳 1 ; 陈宏良 1 ; 胡会刚 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室

关键词： 香蕉;α-淀粉酶;基因家族;系统进化分析

期刊名称： 中国南方果树

ISSN： 1007-1431

年卷期： 2016 年 45 卷 05 期

页码： 12-17+22

收录情况： 北大核心

摘要： α-淀粉酶(Amy)是一类关键的淀粉水解酶,在香蕉果实成熟淀粉降解转化为可溶性糖的过程中发挥着重要作用。本研究基于香蕉基因组数据,通过生物信息学的方法对香蕉α-淀粉酶基因的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、内含子和外显子结构和保守结构域进行初步的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明,编码香蕉α-淀粉酶的基因有12个,根据在染色体的位置命名为MaAmy1~12,MaAmy基因家族编码的氨基酸的范围在79~914个,编码的蛋白相对分子量介于8.8~103.2kD之间,12个MaAmy蛋白中有8个偏酸性,3个偏碱性。不稳定指数分析发现,8个MaAmy蛋白为稳定蛋白;疏水性分析表明,所有的MaAmy蛋白为亲水性蛋白;香蕉MaAmy家族最多的含有13个内含子;进化分析表明,MaAmy家族分4个亚家族。

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