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猪轮状病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR方法的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 陈如敬 1 ; 章秋月 2 ; 陈秋勇 2 ; 修金生 2 ; 吴学敏 2 ; 严山 2 ; 周伦江 3 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;南平市星星畜牧有限公司;福建农林大学动物科学学院

2.;福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;南平市星星畜牧有限公司;福建农林大学动物科学学院

3.;福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;南平市星星畜牧有限公司;福建农林大学动物科学学院;

关键词: 猪轮状病毒;TaqMan;实时荧光定量RT-PCR方法

期刊名称: 福建农林大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-5470

年卷期: 2018 年 02 期

页码: 212-216

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据GenBank中登录的猪轮状病毒(PoRV)VP6基因序列特征,设计特异性的引物和探针,条件优化后,建立检测PoRV TaqMan实时荧光定量RT-PCR方法.结果表明:建立的Taq Man实时荧光定量RT-PCR方法敏感性高,最低可检测192拷贝·μL~(-1);特异性强,对猪常见病原(如猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪瘟病毒和猪流行性乙型脑炎病毒等)检测均为阴性;重复性好,扩增相关系数为0.999,其组内和组间变异系数分别为0.25%~1.26%和0.31%~1.49%.对临床收集的79份猪腹泻病料进行常规RT-PCR检测,检测出阳性样品4份,阳性率为5.06%(4/79);对这79份病料进行TaqMan实时荧光定量RT-PCR方法检测,检测出阳性样品6份,阳性率为7.59%(6/79);同时,4份经RT-PCR检测为阳性的样品经TaqMan实时荧光定量RT-PCR方法检测均为阳性,符合率达100%.本研究建立的方法为PoRV早期感染诊断提供检测手段.

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