文献类型： 中文期刊

作者： 李宁 ¹ ; 杨涛 ¹ ; 杨生保 ¹ ; 唐亚萍 ¹ ; 王柏柯 ¹ ; 王强 ¹ ; 帕提古丽 ¹ ; 余庆辉 ¹ ;

作者机构： 1.新疆农业科学院园艺作物研究所

关键词： 制干辣椒;SCoT标记;正交设计;体系优化

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2015 年 46 卷 04 期

页码： 544-549

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】优化制干辣椒SCo T-PCR反应体系,为新疆制干辣椒种质资源、分子遗传学研究奠定基础。【方法】以制干辣椒为材料,采用L25(55)正交设计方法对影响制干辣椒SCo T-PCR反应体系的Mg2+、模板DNA、引物、DNA聚合酶、d NTPs等因素进行优化筛选。【结果】从25个正交设计组合中筛选获得5个组合的扩增效果较好,扩增条带丰富且清晰度适中、分散性好;经引物SC-12、SC-13、SC-19筛选,获得适用于制干辣椒材料的SCo T-PCR最佳反应体系20.0μL,包含10×Buffer 2.0μL、30 ng模板DNA 0.8μL、2.0 mmol/L Mg2+1.8μL、1.0μmol/L引物1.0μL、1 U Taq DNA聚合酶0.4μL、0.25 mmol/L d NTPs 0.5μL、dd H2O 13.5μL。运用优化体系从80条引物中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SCo T引物24条。【结论】优化的SCo T-PCR反应体系及筛选的引物可用于新疆制干辣椒种质鉴定、遗传图谱构建、遗传多样性的分析等。