文献类型： 中文期刊

作者： 李晨辉 ¹ ; 赵子捷 ¹ ; 陈文烨 ¹ ; 焦义然 ¹ ; 杨帆 ¹ ; 刘永伟 ¹ ; 董福双 ¹ ; 杜进民 ¹ ; 周硕 ¹ ;

作者机构： 1.河北菲尼斯生物技术有限公司;山西农业大学信息学院;河北科技大学生物科学与工程学院;河北省农林科学院遗传生理研究所/河北省植物转基因中心

关键词： CaM1;密码子偏性;遗传距离;亲缘关系

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2019 年 05 期

页码： 28-32

摘要： 为深入了解不同类植物CaM1基因(calmodulin 1,简称CaM1)在抵抗逆境进化过程所形成的密码子的使用特征和遗传差异。运用CodonW、BioEdit和MEGA软件对43种植物序列进行分析,并构建系统发育树。结果表明,CaM1基因对密码子的使用具有极强的偏好性,CUC、AUC、UCU、CCA、ACU、UGA为其最优密码子,禾本目植物更偏好使用G/C碱基。G、C碱基含量和位置是引起CaM1基因密码子偏性的主要原因。遗传距离分析表明,山柑目与白花菜目之间的亲缘关系最近,豆目和无患子目间的亲缘关系次之,与聚类分析结果相符。