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胡椒PnPAL基因家族全基因组鉴定及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

作者： 苏岳峰 1 ; 丁元昊 1 ; 郝朝运 2 ; 胡丽松 2 ; 郑其向 2 ; 范睿 2 ;

作者机构： 1.海南大学

2.中国热带农业科学院香料饮料研究所

关键词： 胡椒;苯丙氨酸解氨酶（PAL）;生物信息

期刊名称： 福建农业学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 619-628

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】胡椒瘟病是影响胡椒产量的第一大病害,胡椒苯丙氨酸解氨酶（PnPAL）基因是胡椒抗瘟病的关键基因。探明胡椒PnPAL基因家族的基本特征、进化关系及表达模式,以便于其功能研究。【方法】通过全基因组查找、鉴定得到14条胡椒PnPAL家族成员,分别命名为PnPAL1～PnPAL14,并对这14条序列进行生物信息学及表达模式分析。【结果】蛋白质基本信息分析显示,该家族理论等电点在5.76～9.77,分子量在7.374 41～83.431 07kDa。有7条胡椒的PnPAL基因含有8个motif和PLN02457保守结构域,该7条胡椒PnPAL家族成员被进一步鉴定为胡椒PnPAL家族成员。胡椒PnPAL家族成员含有诸多胁迫响应元件,特别是水杨酸、茉莉酸甲酯等与抵抗病原入侵的顺式作用元件。胡椒的PnPAL基因位于系统发生树基部位置,表明胡椒的PnPAL基因较为古老,与胡椒的系统地位相似。表达模式分析显示,PnPAL10在受病原诱导后基本呈上调趋势,表明PnPAL10可能是胡椒抗瘟病的关键基因。【结论】对胡椒PnPAL基因家族开展了生物信息学及表达模式分析,证明其在抗瘟病中的潜在作用,筛选到关键家族成员PnPAL3。

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