文献类型： 中文期刊

作者： 赵吉 ¹ ; 冯苗胜 ¹ ; 柯巧珍 ¹ ; 王家迎 ¹ ; 江汀森 ¹ ; 吴雄飞 ² ; 彭士明 ³ ; 白玉麟 ¹ ; 沈伟良 ² ; 周涛 ¹ ; 濮菲 ¹ ; 徐鹏 ¹ ;

作者机构： 1.厦门大学海洋与地球学院

2.宁波市海洋与渔业研究院

3.中国水产科学研究院东海水产研究所

关键词： 大黄鱼;宁芯3号;种质鉴定;机器学习

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2024 年 48 卷 012 期

页码： 28-39

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了高效保护、管理以及利用大黄鱼种质资源,迫切需要开发精准的大黄鱼遗传种质鉴定技术.基于前期开发的大黄鱼"宁芯 3 号"55K液相基因分型芯片,本研究对中国沿海野生群体、闽浙养殖群体和多个选育系共计 21 个大黄鱼群体进行遗传种质鉴定.群体遗传学分析结果揭示大黄鱼群体可划分为南海群体、闽东群体和岱衢群体,其中南海群体遗传分化最为显著.基于机器学习的大黄鱼群体分类结果显示,未知大黄鱼个体所属地理群体鉴定准确率大于99%.未知大黄鱼个体所属遗传改良选育系也具有极高的鉴定准确率,例如经过 3 代选育的抗刺激隐核虫新品系GS3F3,基于神经网络的鉴定精确率可以达到99%.研究表明,利用"宁芯 3 号"芯片和机器学习方法可快速实现大黄鱼种质的精准鉴定.本研究为大黄鱼种质资源精准鉴定和种质管理、育种材料和新品种知识产权保护等提供了有效的工具和解决方案,也可为其他水产生物种质资源鉴定提供借鉴.