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梅花鹿TLR10基因克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张立春 1 ; 王全凯 2 ; 曹阳 1 ; 金海国 1 ; 陈尚武 3 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院畜牧分院

2.吉林省中韩动物科学研究院

3.有害生物控制与资源利用国家重点实验室(中山大学)

关键词: 梅花鹿;TLR10基因;克隆;序列分析

期刊名称: 东北林业大学学报

ISSN: 1000-5382

年卷期: 2013 年 41 卷 01 期

页码: 116-121

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为系统了解梅花鹿免疫系统,用Trizo法提取梅花鹿肝脏总RNA,采用兼并引物RT-PCR方法克隆了梅花鹿TLR10基因并进行了系统的生物信息学分析。RT-PCR结果显示,dTLR10基因完整ORF区长2 439 bp,编码812个氨基酸(GenBank序列号为:HQ260630)。同源分析显示,dTLR10基因序列与其他物种TLR10基因高度同源,与同属于偶蹄目反刍类的牛和羊同源性高达95%以上。蛋白功能结构域分析显示,不同物种间TLR10蛋白结构域数量及分布上高度相似,蛋白三维结构预测比较显示,dTLR10蛋白胞外区结构与人类TLR10结构相似,两者均表现为经典的马蹄形结构。

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