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面包果DNA条形码筛选与遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 高效梅 1 ; 伍宝朵 1 ; 胡丽松 1 ; 谭乐和 1 ; 吴刚 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院香料饮料研究所

关键词: 面包果;DNA条形码;trnL-F序列;序列特征分析;系统发育树

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2023 年 014 期

页码: 4719-4728

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究以30份面包果资源为研究对象,对ITS、g3pdh、marK、trnL-F和rbcL 5种DNA条形码序列进行扩增测序分析,通过多序列比对分析序列特征。利用筛选出的理想DNA条形码序列进行遗传距离分析,构建NJ邻接系统进化树。结果表明,g3pdh和ITS序列变异位点较多,变异没有规律性;matK和rbcL序列保守,变异位点少且集中于某些种质;trnL-F序列较保守,部分变异可作为识别特征。基于trnL-F序列分析面包果资源遗传距离为0~0.033,平均遗传距离为0.010。基于系统发育树结果,可将面包果资源聚为4个分支,推测XYS1-3、XYS1和YBG可能引种于印度尼西亚,XYS2、XYS3、XYS5和XYS6可能引种于越南、泰国等东南亚地区。综上所述,trnL-F序列更适合用于面包果遗传多样性分析,可用于部分种质的鉴别。

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