文献类型： 中文期刊
作者： 柳淑芳 1 ; 李献儒 1 ; 李达 1 ; 庄志猛 1 ;
作者机构： 1.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室
关键词： 鳀科;DNA条形码;探针;DNA芯片;电子杂交
期刊名称： 渔业科学进展
ISSN： 2095-9869
年卷期： 2016 年 37 卷 06 期
页码： 19-25
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 本研究将基于线粒体COI部分序列的DNA条形码和DNA芯片技术相结合,以缇科11属30种鱼类为研究对象,在比对分析其DNA条形码序列的基础上,利用软件Oligo Array 2.1筛选探针,经OligoCalc优化探针,去除易形成发夹(Hairpin)、茎环(Stern-loop)及自身二聚体结构(Homodimers)的探针,再利用Oligo heat map对探针与靶标序列进行虚拟杂交,共有14个物种的24条探针能与靶标序列特异性结合。利用DNA条形码芯片技术能将14个物种鉴定到种,虽然物种识别能力仅占总物种数的46.7%,但鉴定准确率可达100%。因此,基于COI基因的DNA芯片技术对缇科鱼类物种鉴定有一定的实用价值,但该技术对物种的识别能力尚有较大提升空间,通过筛选和优化得到高质量的分子探针则是突破该项技术的关键。
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