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马氏珠母贝EST微卫星的筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 石耀华 1 ; 洪葵 2 ; 郭希明 2 ; 王嫣 2 ; 侯占辉 2 ; 顾志峰 2 ; 王爱民 2 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所,中国热带农业科学院热带生物技术研究所,Haskin Shellfish Research Laboratory Institute of Marine and Coastal Sciences,Rutgers University,6959 Miller Avenue,Port Norris,NJ08349,USA,海南省热带水生生物技术重点实验室,海南省热带水生生物技术重点实验室,海南省热带水生生物技术重点实验室,海南省热带水生生物技术重点实验室,,热带作物生物技术国家重点实验室,华南热带农业大学,海南海口571101,海南省热带水生生物技术重点实验室,海南大学海洋学院教育部热带生物资源重点实验室,海南海口570228,Haskin Shellfish Research Laboratory,Institute of Marine and Coastal Sciences,Rutgers University,6959 Miller Avenue,Port Norris,NJ08349,USA,热带作物生物技术国家重点实验室,华南热带农业大学,海南海口571101,海南大学海洋学院教育部热带生物资源重点实验室,海南海口570228,海南大学海洋学院教育部热带生物资源重点实验室,海南海口570228,海南大学海洋学院教育部热带生物资源重点实验室,海南海口570228,海南大学海洋学院教育部热带生物资源重点实验室,海南海口570228

关键词: 马氏珠母贝;EST-SSR;分子遗传学

期刊名称: 水产学报

ISSN: 1000-0615

年卷期: 2008 年 32 卷 02 期

页码: 174-181

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 构建了马氏珠母贝的血液、足、鳃、胃、肝、心脏、外套膜、珍珠囊和感染多毛虫马氏珠母贝的血液(血感)等9个组织的cDNA文库,测序获得了6979个EST序列,从中查找到了268个重复序列,隶属于243个EST,含微卫星的EST数占EST总数的3.48%。珍珠囊cDNA文库含微卫星的序列所占比例最高,为6.16%,血感的最低,为1.65%。双碱基重复序列130个,占48.5%,(AT/AT)n类型最常见;三碱基类型的83个,占约31%,其中(AAT/ATT)n和(AAG/CTT)n较多;四碱基重复的有30个,占11.2%,(AAAT/ATTT)n占了该类型的约50%。一共能够设计151对微卫星引物,有130对可以扩增,占合成引物总数的86.09%,其中,多态性引物45对。多态性EST-SSR的筛选将为马氏珠母贝的分子遗传学研究、种质鉴定和野生资源保护等提供可靠的工具。

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