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高羊茅光敏色素A基因FaPHYA的克隆与分析（英文）

文献类型： 中文期刊

作者： 王小利 1 ; 吴佳海 1 ; 舒健虹 1 ; 蔡一鸣 1 ; 刘晓霞 1 ; 李小冬 1 ;

作者机构： 1.贵州省草业研究所

关键词： 高羊茅;光敏色素A基因;克隆;表达分析

期刊名称： Agricultural Science & Technology

ISSN： 1009-4229

年卷期： 2015 年 09 期

页码： 1851-1856

摘要： 以高羊茅转录组学测序获得的PHYA序列为模板,同时结合3’RACE和5’RACE方法从高羊茅中扩增出PHYA基因的全长c DNA序列,命名为Fa PHYA。该序列c DNA全长3 983 bp,具有完整的开放阅读框(ORF,293~3 682 bp),编码蛋白为1 129个氨基酸,Fa PHYA的N端由GAF和Phytochrome结构域组成;C端包括2个重复的PAS结构域,1个组氨酸激酶A结构域,1个类似组氨酸激酶的ATP酶结构域。对编码蛋白氨基酸序列的同源性分析表明,Fa PHYA与单子叶植物PHYA蛋白的氨基酸序列一致性较高,同源一致性水平达85%以上,亲缘关系较近。与双子叶植物的PHYA蛋白的氨基酸序列一致性较低,亲缘关系相对较远。

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