文献类型： 中文期刊
作者： 朱艳 1 ; 郝艳宾 1 ; 王克建 1 ; 吴春林 1 ; 王维霞 1 ;
作者机构： 1.北京市农林科学院林业果树研究所
关键词： 核桃;EST;SSR信息
期刊名称： 果树学报
ISSN： 1009-9980
年卷期： 2009 年 26 卷 03 期
页码： 394-398
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用生物信息学方法,从dbEST数据库用SSRHunter软件对4 500条核桃EST序列进行搜索,发现462个SSR分布于399条EST序列中,EST-SSR出现频率10.27%,平均每5.65 kb EST出现一个SSR。核桃二核苷酸重复基元占主导地位,其次为三核苷酸重复基元,分别占总SSR的49.57%和27.27%。核桃二核苷酸EST-SSR的优势类型为AG,其次为AT,分别占二核苷酸SSR的67.25%和28.38%。核桃三核苷酸EST-SSR的优势重复基元为AAG,其次为ACC、AAT、AGG,分别占三核苷酸SSR的25.40%、21.43%、16.67%和11.11%。用Primer Primer 5.0软件设计了11对引物,对核桃属5个样品进行PCR扩增,10对引物有扩增产物,引物有效扩增率90.9%,其中7对引物有多态性,多态性引物占可扩增引物的70%。表明,利用核桃EST序列开发EST-SSR标记是可行的。
- 相关文献
[1]大白菜表达序列标签SSR标记分析. 葛佳,谢华,崔崇士,洪剑明,马荣才. 2005
[2]一种简单、快速克隆玉米功能基因的方法. 邹华文,朱玉梅,黄丛林,田小海. 2007
[3]辣椒EST-SSR信息分析及标记开发. 张宇,张晓芬,陈斌,耿三省,李焕秀,李珍. 2010
[4]不同居群马蔺种质材料同工酶酶谱特征分析. 李强栋,孟林,毛培春,张德罡. 2012
[5]一种简单、快速克隆玉米功能基因的方法. 邹华文,朱玉梅,黄丛林,田小海. 2007
[6]酯酶(EST)和酸性磷酸酯酶(ACP)同工酶电泳技术在绿菜花和西瓜F1代杂交种纯度检测中的应用. 李丽,郑晓鹰,邢宝田. 1999
[7]大白菜软腐病抗性相关基因分子标记的开发. 陈昌龙,赵雪,孙旺旺,李晓颖,田宇,李未然,谢华. 2019
[8]马蔺不同生长阶段嫩叶POD和EST同工酶分析. 李强栋,孟林,毛培春,张德罡,韩润英. 2011
[9]西瓜抗枯萎病相关EST-SSR的信息分析. 冯建明,郭绍贵,吕桂云,陈年来,张海英,宫国义,许勇. 2009
[10]Comprehensive analysis of expressed sequence tags from cultivated and wild radish (Raphanus spp.). Shen, Di,Qiu, Yang,Li, Xixiang,Shen, Di,Sun, Honghe,Huang, Mingyun,Zheng, Yi,Fei, Zhangjun,Sun, Honghe,Fei, Zhangjun. 2013
[11]Latest Advances in Watermelon Genomics. Guo, Shaogui,Xu, Yong,Zhang, Haiying,Gong, Guoyi,Guo, Shaogui,Zheng, Yi,Fei, Zhangjun,Huang, Sanwen,Yi, Hongping,Wu, Mingzhu,Fei, Zhangjun,Zheng, Yi. 2010
[12]Phylogenetic Analysis and Expression Patterns of the MAPK Gene Family in Wheat (Triticum aestivum L.). Lian Wei-wei,Tang Yi-miao,Gao Shi-qing,Zhang Zhao,Zhao Xin,Zhao Chang-ping,Lian Wei-wei. 2012
[13]Identification and characterization of a subset of microRNAs in wheat (Triticum aestivum L.). Su, Chun,Gao, Shiqing,Tang, Yimiao,Zhao, Changping,Li, Lei,Su, Chun,Yang, Xiaozeng,Li, Lei.
[14]核桃晚霜危害特性及影响机制研究进展. 张绥林,李洋,李琰,张赟齐,齐建勋,侯智霞. 2024
[15]核桃新品种‘京香2号’. 齐建勋,郝艳宾,吴春林,陈永浩,王维霞,董宁光. 2013
[16]核桃抗氧化作用研究进展. 陈永浩,李俊,郭雪霞,齐建勋,吴春林,郝艳宾. 2012
[17]核桃新品种‘美香’. 郝艳宾,陈永浩,董宁光,吴春林,齐建勋. 2018
[18]基于主成分分析的核桃品种油用性状综合评价. 徐梦婷,王强,郝艳宾,齐建勋,张赟齐,丁保淼,陈永浩. 2024
[19]核桃属种质资源的EST-SSR标记研究. 齐建勋,郝艳宾,朱艳,吴春林,王维霞,冷平. 2011
[20]核桃新品种‘京香1号’. 齐建勋,郝艳宾,吴春林,王维霞,陈永浩,朱艳. 2011
作者其他论文 更多>>
-
核桃新品种'京红1号'
作者：张赟齐;陈永浩;蔡亚军;董宁光;戚元勇;雷依阳;郝艳宾;齐建勋
关键词：核桃;红色种皮;避晚霜;抗病;耐寒;品种
-
基于主成分分析的核桃品种油用性状综合评价
作者：徐梦婷;王强;郝艳宾;齐建勋;张赟齐;丁保淼;陈永浩
关键词：核桃;表观性状;理化与营养品质;主成分分析;综合评价
-
挤压处理下组织化核桃蛋白品质变化
作者：张佳宁;王陈艳;郝艳宾;张赟齐;田益玲;丁保淼;齐建勋;陈永浩
关键词：核桃蛋白;挤压工艺;组织化;响应面法;参数优化
-
核桃油营养特性及其制备方法研究进展
作者：徐梦婷;郝艳宾;齐建勋;张赟齐;丁保淼;陈永浩
关键词：核桃油;化学组成;功能活性;制备方法;氧化稳定性
-
109份丰产核桃单株坚果表型多样性分析及性状评价
作者：张赟齐;董宁光;郝艳宾;陈永浩;张俊佩;侯智霞;苏淑钗;吴佳庆;齐建勋
关键词：核桃;种质资源;表型性状;隶属函数法;综合评价
-
超微粉碎处理对核桃蛋白结构及功能性质的影响
作者：张佳宁;李俊;郝艳宾;齐建勋;张赟齐;田益玲;陈永浩
关键词：核桃蛋白;超微粉碎;粒径;结构;功能性质
-
多酚与蛋白相互作用对蛋白特性影响研究进展
作者：徐梦婷;郝艳宾;齐建勋;丁保淼;陈永浩
关键词：多酚;蛋白质;相互作用;蛋白特性
