您好，欢迎访问江苏省农业科学院 机构知识库！
江苏省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

雷蒙德氏棉PIF-like转座元件鉴定与特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐珍珍 1 ; 彭珍 2 ; 刘静 2 ; 沈新莲 1 ; 杜建厂 2 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花和油菜重点实验室

2.江苏省农业科学院生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室

关键词： PIF-like转座元件;雷蒙德氏棉;生物信息学;基因组

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2016 年 28 卷 02 期

页码： 138-143

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： PIF-like转座元件在植物基因组中含量丰富,是植物DNA转座子的重要组成部分。利用基因组学和生物信息学的研究手段,系统研究了雷蒙德氏棉全基因组水平PIF-like转座元件的数量、染色体分布、结构特征、表达模式及相邻基因的种类和功能等,共鉴定了440条包含转座酶且插入位置明确的PIF-like转座元件。这些元件几乎均匀地分布在13条染色体上,上下游2 kb内共有171个相邻编码蛋白的基因,其中132个基因注释到了GO数据库中,且这些基因的功能分布广泛;部分PIF-like转座元件表达,且具有组织特异性。这些遗传信息为深入研究棉花PIF-like转座元件介导的基因和基因组的进化规律以及棉花基因的功能奠定基础。

  • 相关文献

[1]雷蒙德氏棉DnaJ蛋白的生物信息学预测及盐胁迫下的表达分析. 徐珍珍,郭琪,刘静,徐鹏,张香桂,沈新莲. 2015

[2]棉花FAR1/FHY3基因家族的全基因组分析. 袁娜,王彤,刘廷利,杨郁文,郭月,刘静,张保龙,杜建厂. 2018

[3]大豆耐非生物胁迫新基因的发掘与利用. 马鸿翔,易金鑫,王长彪,许玲,徐照龙,何晓兰,黄益洪,ZULFIQAR A. 2011

[4]金黄色葡萄球菌特异性PCR检测靶点的自动化筛选. 范一灵,朱东升,胡瑜,史贤明. 2011

[5]新型冠状病毒(SARS-CoV-2)与常见家养动物冠状病毒的同源性分析. 时丹怡,范宝超,常新见,黄伟,李彬. 2020

[6]江苏葫芦科作物上瓜类褪绿黄化病毒的发生及其分离物全基因组序列分析. 杨柳,任春梅,陆芳,缪倩,程兆榜,季英华. 2024

[7]产气荚膜梭菌噬菌体鉴定及其环境消减效果评价. 吴立婷,刘半红,田源,王娟,包红朵,周艳,庞茂达,王冉,张辉. 2022

[8]一株源于商品胎牛血清的BVDV-2型的分离鉴定及基因组序列分析. 李艳萍,王立群,李慧霞,梁盼红,才学鹏,毛立,骆学农. 2020

[9]反向疫苗学在猪病疫苗研究中的应用. 缪芬芳,白方方,王海燕,刘茂军,熊祺琰,冯志新,邵国青. 2011

[10]自然界斜纹夜蛾核型多角体病毒的基因型多态性(英文). 刘艳荷,王利华,方继朝. 2013

[11]甘薯近缘种Ipomoea trifida (Kunth) G.Don基因组Fosmid文库构建及PCR筛选体系建立. 李昂,吴志明,周志林,赵冬兰,张安,马代夫,李亚栋,唐君,曹清河. 2014

[12]棉花YABBY基因家族的全基因组分析. 徐珍珍,倪万潮,张香桂,郭琪,徐鹏,沈新莲. 2015

[13]猪细小病毒1~7型全基因组遗传变异. 华涛,常晨,李倩文,张道华,唐波. 2024

[14]漾濞槭全基因组微卫星分布特征. 史雯茜,马秋月,陈梓馨,李倩中,李淑娴,李淑顺,朱长虹,朱璐,颜坤元,杜一鸣. 2024

[15]Ipomoea trifida花青素合成酶基因ANS的电子克隆与生物信息学分析. ZHANG An,张安,CAO Qing-he,曹清河,ZHOU Zhi-lin,周志林,ZHAO Dong-lan. 2013

[16]葡萄miR164家族生物信息学分析及靶基因预测. 王丽丽,葛金涛,刘兴满,赵统利. 2016

[17]类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测. 温立斌,何孔旺,杨汉春,王玉然. 2009

[18]黄瓜MLO型基因家族成员的鉴定及生物信息学分析. 夏礼如,钱春桃. 2013

[19]甘蓝型油菜GPDH基因克隆、表达分析及植物过表达载体构建. 张超,付三雄,周小婴,唐容,黄莎,杨克相,戚存扣. 2019

[20]猪链球菌4型GalR蛋白的生物信息学分析及原核表达. 孙珂,祝昊丹,周俊明,王丹丹,俞正玉,吕立新,何孔旺,李彬,倪艳秀. 2021

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：江苏省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台