您好,欢迎访问湖北省农业科学院 机构知识库!

加系大白猪乳头数性状的全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周佳伟 1 ; 张宇 1 ; 吴俊静 1 ; 乔木 1 ; 徐忠 1 ; 李梓芃 1 ; 杨前平 1 ; 彭先文 1 ; 梅书棋 1 ;

作者机构: 1.动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室

关键词: 猪;乳头数;全基因组关联分析;SNP

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2022 年 58 卷 008 期

页码: 141-146

收录情况: 北大核心

摘要: 乳头数是母猪重要繁殖性状,影响断奶仔猪存活率.研究者对不同品种和品系的猪相继开展了乳头数性状相关数量性状座位(Quantitative Trait Locus,QTL)鉴定,但目前关于加系大白猪乳头数性状相关QTL的研究较少.本研究以944头加系大白猪群体为研究对象,对乳头数性状进行全基因组关联分析(GWAS).GCTA软件计算左、右、总乳头数性状的遗传力分别为0.1、0.12、0.16.利用rMVP软件在SSC7上分别检测到4、1、4个与左、右和总乳头数基因组水平显著相关(P<1.26×10-6)的SNP,其中1个SNP位于SSC7的14.1 Mb,剩余3个SNP位于SSC7的97.6~102.0 Mb.在SSC3、SSC4、SSC6、SSC7、SSC9、SSC11、SSC13上分别鉴定到4、1、4、5、1、1、5个与乳头数性状潜在显著相关(P<2.52×10-5)的SNP.进一步扫描25个显著相关SNP上下游200 kb位置处的基因,共获得84个候选基因,其中SSC7上获得39个候选基因,包括FAM71D、MPP5、EIF2S1、PIGH、ARG2、RDH11、RDH12、VRTN、SYNDIG1L等候选基因.本研究为猪乳头数的选育提供了新的分子标记和候选基因.

  • 相关文献

[1]大白猪繁殖性状全基因组关联分析. 张宇,周佳伟,吴俊静,乔木,徐忠,李梓芃,彭先文,梅书棋. 2022

[2]猪SPATA6基因的多态性与精液品质性状的关联分析. 周佳伟,吴俊静,乔木,刘贵生,彭先文,梅书棋. 2019

[3]猪DKK2基因的多态性与母猪产仔数性状的关联分析. 周佳伟,乔木,吴俊静,王孝忠,刘贵生,梅书棋,彭先文. 2020

[4]猪THRSP基因多态性及其与肉质性状的关联分析. 李钰洁,周佳伟,张宇,李梓芃,乔木,张志红,吴俊静,彭先文,梅书棋,徐忠. 2024

[5]大白猪乳头数与繁殖性状的关系研究. 李良华,董斌科,宋忠旭,赵海忠,孙华,吴俊静,彭先文,梅书棋. 2020

[6]硒都黑猪繁殖性状全基因组关联分析. 宋忠旭,张宇,彭先文,吴俊静,李良华,董斌科,乔木,徐忠,李梓芃,周佳伟,孙华,梅书棋. 2022

[7]基于NCⅡ遗传交配设计的籼稻抽穗期全基因组关联分析. 徐凯,郑兴飞,张红燕,胡中立,宁子岚,李兰芝. 2023

[8]鸡重要性状全基因组关联分析研究现状及展望. 潘爱銮,皮劲松,申杰,吴艳,蒲跃进,梁振华,张昊,孙静,程妮,杜金平. 2017

[9]鸡KRT14基因编码区SNPs及其与蛋壳品质性状的相关分析. 沈涛涛,张佳兰,吴艳,程诗彬,皮劲松,黄竹林,王孝忠. 2021

[10]江汉鸡群体FSHβ基因遗传多态位点分析. 黄涛,潘爱銮,申杰,吴艳,蒲跃进,张昊,孙静,梁振华,杜金平,朱昌友,皮劲松. 2021

[11]鸡HDLBP基因SNP鉴定及其与蛋用性能关联分析. 黄涛,程璐,莫长欢,王孝忠,申杰,皮劲松,龚炎长. 2020

[12]基于SNP标记揭示我国小麦品种(系)的遗传多样性. 刘易科,朱展望,陈泠,邹娟,佟汉文,朱光,何伟杰,张宇庆,高春保. 2020

[13]山羊NFAT5基因启动子区多态性与生长性状的关联分析. 许铭洙,杨娟,刘泽林,张年,刘静波,陶虎. 2023

[14]利用转录组技术鉴定影响硒都黑猪肌内脂肪含量性状关键基因及标记的研究. 吴俊静,田海斌,刘晓哲,乔木,周佳伟,孙华,彭先文,梅书棋. 2023

[15]基于SNP标记的玉米株高及穗位高QTL定位. 郑德波,杨小红,李建生,严建兵,张士龙,贺正华,黄益勤. 2013

[16]Molecular characterization, transcriptional regulation and association analysis with carcass traits of porcine TCAP gene. Qiao, Mu,Wu, Huayu,Wu, Junjing,Peng, Xianwen,Mei, Shuqi,Huang, Jingshu.

[17]One novel SNP of growth hormone gene and its associations with growth and carcass traits in ducks. Wu, Y.,Pan, A. L.,Pi, J. S.,Pu, Y. J.,Du, J. P.,Liang, Z. H.,Shen, J.,Wu, Y..

[18]An SNP in the MyoD1 gene intron 2 associated with growth and carcass traits in three duck populations. Wu, Y.,Pi, J. S.,Pan, A. L.,Pu, Y. J.,Du, J. P.,Shen, J.,Liang, Z. H.,Wu, Y.,Zhang, J. R..

[19]Polymorphism and association analysis with carcass traits of porcine USF1 gene. Wu, Hua-Yu,Qiao, Mu,Peng, Xian-Wen,Wu, Jun-Jing,Liu, Gui-Sheng,Sun, Hua,Li, Liang-Hua,Mei, Shu-Qi.

[20]Molecular characterization, expression profile and association analysis with carcass traits of porcine LCAT gene. Deng, Chang-Yan,Qiao, Mu,Li, Feng-E,Jiang, Si-Wen,Xiong, Yuan-Zhu,Deng, Chang-Yan,Qiao, Mu,Li, Feng-E,Jiang, Si-Wen,Xiong, Yuan-Zhu,Deng, Chang-Yan,Wu, Hua-Yu.

作者其他论文 更多>>