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猪输血传播病毒2型福建株ORF1基因特征

文献类型： 中文期刊

作者： 修金生 1 ; 陈如敬 2 ; 吴学敏 2 ; 王斌 1 ; 李涛 1 ; 林群群 1 ;

作者机构： 1.福建农林大学动物科学学院

2.福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心

关键词： 猪输血传播病毒;ORF1基因;特征

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2013 年 28 卷 01 期

页码： 14-17

摘要： 参照GenBank中登录的猪输血传播病毒2型(Torque Teno Virus genogroup 2,TTV2)ORF1基因序列特征设计特异性引物,采用PCR方法对从福建省某猪场采集的血液基因组DNA中扩增到猪输血传播病毒2型ORF1基因,并对目的片段进行克隆测序。结果表明,所扩增的目的片段编码有TTV2完整的ORF1基因开放阅读框,全长为1 875bp,编码有624个氨基酸。运用生物信息学软件,将获得猪TTV2福建株ORF1基因序列和GenBank中登录的猪TTV2进行分析比较,其和FJ/China/2010/TTV2/2(GenBank登录号JF937656)的同源性高达98.8%,和四川株(GenBank登录号HQ204188)核苷酸同源性最低,仅为83.5%。从遗传进化上看,猪输血传播病毒2型可以分为3个明显的分支亚群,福建分离株在基因1群和基因2群均有分布,推测福建省存在多亚群猪TTV2流行。

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