文献类型： 中文期刊
作者： 王茂辉 1 ; 钟春燕 1 ; 罗文龙 1 ; 聂金泉 1 ; 郭涛 1 ; 王慧 1 ; 陈志强 1 ;
作者机构： 1.肇庆市农业科学研究所;华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心;广东省农业科学院蔬菜研究所
关键词： 水稻斑点叶突变体;分子标记;高通量测序;基因定位;序列比对
期刊名称： 广东农业科学
ISSN： 1004-874X
年卷期： 2018 年 10 期
页码： 1-8+174
摘要： 水稻斑点叶突变体Spl34是自然获得的突变体,在研究其形态学和生理生化等方面的基础上,利用粳稻Francis和Spl34杂交构建F_2基因定位群体进行精细定位研究,遗传分析表明Spl34的斑点叶表型受单个显性基因Spl34(t)调控;利用SSR/InDel标记对无斑点叶隐性单株进行连锁分析,将Spl34(t)精细定位于第11号染色体23.483～23.530 Mb之间,定位区间长度为46.99 kb,筛选出8个候选基因。另外,利用高通量测序技术对F_2(Francis/Spl34)有斑点个体混合池、无斑点个体混合池以及双亲进行重测序,利用基因组SNP对有斑点和无斑点混合池进行关联分析,将Spl34(t)定位于第11号染色体23.223～23.791 Mb之间,区间大小约568 kb;进一步利用单分子测序技术对Spl34突变体进行测序,通过从头组装、关联分析,在两个重叠群tig00001409和tig00003011检测到紧密连锁。通过对两个重叠群之间序列进行Sanger测序并产生的新重叠群长度达到233.95 kb,其中Spl34(t)定位区间大小约40 kb。将斑点叶基因Spl34(t)精细定位于第11号染色体约40 kb的区间,为进一步开展该基因的功能研究奠定了良好基础。
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