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玉米耐盐基因ZmHKT1的序列变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 姜志磊; 姜昱; 刘艳芝; 蒋超; 金峰学;

关键词： 玉米;ZmHKT1基因;单核苷酸多态性(SNP);InDel;连锁不平衡;单倍型

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2015 年 23 卷 05 期

页码： 39-48

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： HKT(High-affinity potassium transporter,高亲和性钾转运蛋白)基因所编码的蛋白能起到维持植物体内的Na+/K+平衡的作用。在作物中HKT蛋白主要通过排出叶片中的Na+,从而提高植物耐盐性。对54份玉米自交系材料的Zm HKT1基因及上游序列进行多态性分析。结果表明,在3 784 bp的序列中,共有194个SNP和32个In Del。大部分变异集中在基因上游序列和内含子区,编码区的变异相对较少,说明编码区在进化和人工选择中承受了更大的选择压力。根据序列变异情况可将54份玉米自交系材料划分为15个单倍型,上游序列主要存在3种单倍型,而基因序列存在9种单倍型。遗传重组和连锁不平衡分析发现,全长序列只有3次重组事件发生,上游序列存在着非常强的连锁不平衡。

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