您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

基于转录组测序对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)2种肌球蛋白重链基因的克隆与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈之航 1 ; 董浚键 2 ; 孙成飞 2 ; 田园园 2 ; 叶星 3 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所;上海海洋大学水产与生命技术学院

2.;中国水产科学研究院珠江水产研究所;上海海洋大学水产与生命技术学院

3.;中国水产科学研究院珠江水产研究所;上海海洋大学水产与生命技术学院;

关键词: 翘嘴鳜;转录组测序;肌球蛋白重链;cDNA克隆;表达分析

期刊名称: 渔业科学进展

ISSN: 2095-9869

年卷期: 2017 年 03 期

页码: 51-61

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 肌球蛋白重链(Myosin heavy chain,MYH)是骨骼肌粗肌丝的重要组成单位,其表达量高低影响肌纤维的组成和肌肉生长。为了解其在翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)早期生长过程中的作用,本研究从前期生长差异显著的2组(快长组和慢长组)翘嘴鳜幼鱼转录组差异表达Unigene中筛选出2个MYH基因,RACE(Rapid amplification of c DNA ends)克隆到其全长c DNA(MYH-7a,MYH-7b)。MYH-7a全长为6071 bp,开放阅读框为5820 bp;MYH-7b全长为5896 bp,开放阅读框为5745 bp。序列分析显示,2个MYH均有Loop1、Loop2环、ATP结合位点等关键结构域;进化树聚类分析显示,MYH-7a与MYH-7b均属于慢肌球蛋白。实时荧光定量PCR验证发现,其在快长组样本中表达量显著高于慢长组,与转录组测序结果一致;检测其在翘嘴鳜心肌、红白肌和皮肤等14种组织的表达水平,结果显示,MYH-7a主要在心肌中表达,而MYH-7b主要在红肌中表达;在胚胎发育不同阶段,二者随着胚胎发育的进行,表达量不断增加;在幼鱼早期生长过程(孵化出膜后15 dph、30 dph和60 dph)的翘嘴鳜白肌中,在15 dph和30 dph快长组的表达量显著高于慢长组,而到60 dph时快长组的表达量均显著低于慢长组。翘嘴鳜MYH-7a、MYH-7b在快长组与慢长组鱼中的差异表达提示它们在翘嘴鳜胚胎及其早期生长发育过程中发挥重要作用。

  • 相关文献

[1]温度对摄食配合饲料翘嘴鳜胃排空速率的影响. 汪福保,董浚键,孙成飞,王淼,程光兆,卢迈新,叶星. 2023

[2]氨氮胁迫对翘嘴鳜幼鱼抗氧化酶、消化酶活性及应激相关基因表达的影响. 孙阿君,丁炜东,曹丽萍,曹哲明,邴旭文. 2024

[3]翘嘴鳜选育群体早期生长及主要性状的主成分分析. 张进,王亚军,周彩杏,刘灿洪,余伟祥,曾金龙. 2013

[4]翘嘴鳜、斑鳜及其杂交种形态差异分析. 赵建,朱新平,陈永乐,刘毅辉,谢刚. 2008

[5]翘嘴鳜3个不同群体的遗传多样性分析. 曾庆凯,孙成飞,董浚键,田园园,师红亚,焦真真,叶星. 2017

[6]翘嘴鳜microRNA转录组分析及生长相关miRNA鉴定. 王博,田园园,孙成飞,董浚键,叶星. 2017

[7]翘嘴鳜主要形态性状与体重的相关性及雌雄形态性状差异分析. 董浚键,孙成飞,田园园,曾庆凯,师红亚,卢迈新,叶星. 2018

[8]广东与江西翘嘴鳜养殖与天然种群的遗传多态性分析. 杨宇晖,梁旭方,林群,李锦光,王琳,谢骏. 2010

[9]翘嘴鳜微卫星标记亲权鉴定技术的建立与应用. 曾庆凯,孙成飞,董浚键,田园园,叶星. 2017

[10]翘嘴鳜转录组测序及SSR新标记的开发与应用. 孙海林,孙成飞,董浚键,田园园,胡婕,叶星. 2019

[11]急性氨氮胁迫对翘嘴鳜幼鱼抗氧化酶活性及炎症反应相关基因表达的影响. 刘雨,丁炜东,曹哲明,邴旭文,徐畅,杨帆,张晨光,谷心池,孙阿君. 2019

[12]人工配合饲料池塘养殖翘嘴鳜广清1号生长模型构建. 汪福保,程光兆,董浚键,孙成飞,王淼,卢迈新,叶星. 2022

[13]江苏省6个翘嘴鳜群体的遗传多样性分析. 颜元杰,曹哲明,丁炜东,邴旭文. 2019

[14]翘嘴鳜病原嗜水气单胞菌分子特征及LAMP检测方法的建立. 张悦,高晓建,叶金明,陈楠,杜雪地,张晓君,邴旭文. 2017

[15]摄食配合饲料翘嘴鳜快长组与慢长组转录组特征比较分析. 陈晓,孙成飞,董浚键,张赫桐,田园园,高风英,叶星. 2023

[16]翘嘴鳜、斑鳜及其杂交后代的胚胎和胚后发育比较. 刘毅辉,陈永乐,朱新平,谢刚,黄伟平,洪孝友,李海潮,张伟康,陈少华. 2012

[17]斑节对虾TLR22基因的克隆与表达. 刘文静,杨丽诗. 2011

[18]暗纹东方鲀sox9基因的克隆和组织表达分析. 高莹莹,刘新富,胡鹏,刘滨,郭正龙. 2019

[19]草鱼(Ctenopharyngodon idellus)成纤维细胞生长因子8的cDNA克隆及特征分析. 孙翰昌,丁诗华,方平,张芬,李云,刁晓明. 2009

[20]黄鳝cGnRH-Ⅱ的cDNA克隆与序列分析. 方平,李英文,胡炜,丁诗华. 2007

作者其他论文 更多>>