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1型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR全长基因的扩增及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 向蓉 1 ; 岳磊 1 ; 李林林 1 ; 孙敏华 1 ; 董嘉文 1 ; 胡奇林 1 ; 袁建丰 1 ;

作者机构： 1.广东省农科院动物卫生研究所/广东省兽医公共卫生公共实验室

关键词： 1型鸭疫里默氏杆菌;铁依赖抑制子;SiteFinding-PCR;生物信息学分析

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2013 年 40 卷 23 期

页码： 133-137

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了扩增1型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子基因(RaDtxR)全长序列,对SiteFing-PCR技术做了改良。改良后的SiteFinding-PCR技术更加简单、方便且省时。SiteFinding-PCR结果显示,获得的目的片段大小为937 bp,向前延伸了710 bp。RaDtxR全长基因序列为654个核苷酸,编码217个氨基酸。生物信息学表明,RaDtxR包含完整的铁离子依赖抑制子超家族保守结构域,在进化分类上更接近于白喉棒状杆菌毒素抑制子DtxR。同源建模表明,RaDtxR氨基酸序列含有典型的FUR/DtxR抑制子的HTH结构。

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