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基于测序技术的海南地方猪TLR2基因多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张艳 1 ; 刘海隆 2 ; 王文秀 2 ; 黄丽丽 2 ;

作者机构： 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所

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关键词： 海南地方猪;TLR2;基因多态性;基因测序

期刊名称： 畜牧与兽医

ISSN： 0529-5130

年卷期： 2019 年 007 期

页码： 46-50

收录情况： 北大核心

摘要： 为了解海南地方猪TLR2基因的多态性,本研究采用PCR法从五指山猪、临高猪和屯昌猪3种海南地方猪的血液中克隆Toll样受体2(TLR2)基因,并进行测序及序列分析.结果显示,3种海南地方猪TLR2基因的扩增长度均为2 649 bp,编码区长2 358 bp.3种猪TLR2基因序列的种内比对结果显示,五指山猪种内有7个核苷酸位点存在多态性,2处位于编码区;屯昌猪种内有5个核苷酸位点存在多态性,均在编码区外;临高猪种内有4个核苷酸位点存在多态性,1处位于编码区.种间比对结果显示3种猪有12个核苷酸位点存在多态性,其中3处为错义突变,导致氨基酸改变.同源性分析结果显示,3种猪的TLR2基因序列高度保守,同源性在99.6%~99.9%之间.蛋白质结构预测分析显示,海南猪TLR2基因在876、1454位点呈现的AG突变均引起了其蛋白质二级结构和三级结构的改变,提示可能存在TLR2功能的变化.本研究填补了海南地方猪TLR2基因多态性空白,为深入研究TLR2基因多态性与猪疫病易感性的关系提供基础研究资料.

  • 相关文献

[1]基于测序技术的海南地方猪TLR4基因多态性分析. 张艳,刘海隆,王文秀,黄丽丽. 2019

[2]山羊LHβ基因多态性与产羔数的相关分析. 孙瑞萍,王利心,王建刚,朱广琴,宋宇轩,曹斌云. 2009

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