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采用高通量测序技术对生驼乳中细菌群落多样性研究

文献类型： 中文期刊

作者： 王帅 1 ; 王富兰 1 ; 赵艳坤 1 ; 武亚婷 1 ; 李新霞 1 ; 马宪兰 1 ; 陈贺 1 ;

作者机构： 1.新疆农业科学院农业质量标准与检测技术研究所/农业部农产品质量安全风险评估实验室/新疆农产品质量安全实验室

关键词： 高通量测序;生驼乳;细菌多样性

期刊名称： 中国奶牛

ISSN： 1004-4264

年卷期： 2024 年 012 期

页码： 38-43

摘要： 为全面了解生驼乳中的细菌多样性，采用Illumina Miseq高通量测序技术分析生驼乳中的菌落结构和优势菌群。对四个季度从乌鲁木齐市及木垒县采集的96个驼乳样本，提取全基因组，通过高通量测序方法进行研究，获得多样性信息。结果显示，96个样本测序共获得7 254 239对有效序列，夏季特定OTU数量高达84个，春季特定OTU数量较多，冬季相对较低。本研究在高通量测序技术手段的分析下，驼乳的细菌群落共分为34个门、87个纲、131个目、254个科、587个属、412个种。驼乳的细菌群落从门水平上共分离出34种，优势菌群为变形菌门（Proteobacteria）。影响驼乳样本中微生物群落结构组成差异的主要因素是季节。

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