文献类型: 中文期刊
作者: 王解香 1 ; 白俊杰 1 ; 于凌云 1 ;
作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所
关键词: 草鱼;EST-SSR;生长性状;关联分析;遗传多样性
期刊名称: 淡水渔业
ISSN: 1000-6907
年卷期: 2012 年 42 卷 01 期
页码: 3-8+29
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 利用草鱼(Ctenopharyngodon idella)EST(expressed sequence tags)数据库开发的18个EST-SSR标记,对草鱼群体进行基因型与生长性状关联分析和群体遗传多样性分析,结果表明:关联分析得到6个微卫星位点(13118、13305、24017、25085、35939和40698)与体重,体长和体高显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01)。对其进行多重比较获得有利基因型分别为13118位点的BB、13305位点的AD、24017位点的AC、25085位点的BE、35939位点的BB和40698位点的BB。将6个微卫星位点上的EST序列与GenBank数据库进行BLAST比对,其中24017序列与鲤鱼自然杀伤细胞增强因子(NCEF)同源性水平高达86%,25085序列与草鱼反应元件结合蛋白(CREB)的基因同源性水平达到80%。应用这18个微卫星位点对草鱼养殖群体进行遗传多样性分析,共检测到82个等位基因,平均等位基因4.556个,每个位点检测到的等位基因数为2~9个,群体的平均观测杂合度为0.452 9,平均期望杂合度和平均多态信息含量分别为0.457 1和0.401 7,表明该群体遗传多样性处于低水平。
- 相关文献
[1]草鱼载脂蛋白A-Ⅰ-1基因3'非编码区SNPs筛选及其与生长性状的关联分析. 刘小献,白俊杰,于凌云,李胜杰. 2012
[2]草鱼羧肽酶A4基因部分序列多态性及生长性状关联分析. 曹婷婷,刘小献,白俊杰,于凌云. 2012
[3]草鱼载脂蛋白A-I-1基因3'非编码区SNPs筛选及其与生长性状的关联分析. 刘小献,白俊杰,于凌云,李胜杰. 2012
[4]泥蚶G2代快速生长家系遗传结构的微卫星分析及其与生长性状的关联. 滕爽爽,方军,邵艳卿,林兴管,柴雪良,肖国强. 2018
[5]大口黑鲈生长性状的微卫星DNA标记筛选. 樊佳佳,白俊杰,李小慧,何小平,何小燕,李胜杰,叶星,吴立新. 2009
[6]草鱼幼鱼生长性状和肌肉成分的遗传参数估计. 傅建军,张猛,沈玉帮,徐晓雁,孙俊龙,李家乐. 2015
[7]草鱼PRL基因多态性与幼鱼生长性状和肌肉成分的关联分析. 傅建军,张猛,沈玉帮,陈勇,徐晓雁,李家乐. 2016
[8]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021
[9]草鱼生长性状的遗传参数和育种值估计. 姜鹏,韩林强,白俊杰,樊佳佳,陈柏湘,胡重江,周春龙,李胜杰. 2018
[10]草鱼MyoD基因SNP和Indel标记的筛选及其与生长性状的关联分析. 陈静,何吉祥,樊佳佳,黄龙,吴本丽,宋光同,汪翔,武松. 2018
[11]草鱼柠檬酸合酶基因SNP筛选及与生长性状的关联分析. 樊佳佳,刘小献,白俊杰,于凌云. 2014
[12]不同地理来源草鱼群体杂交后代的生长性能分析(英文). 樊佳佳,陈柏湘,白俊杰,姜鹏,韩林强,于凌云. 2016
[13]不同地理来源草鱼群体杂交后代的生长性能分析. 樊佳佳,陈柏湘,白俊杰,姜鹏,韩林强,于凌云. 2015
[14]大口黑鲈HSC70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析. 李胜杰,樊佳佳,姜鹏,白俊杰,孙建国,吴建开,费志平. 2018
[15]大口黑鲈肌球蛋白重链基因SNPs的筛选及与生长性状的关联. 李胜杰,姜鹏,樊佳佳,白俊杰,李锐,朱新平. 2018
[16]草鱼醛缩酶A3'-UTR突变与生长性状相关研究. 李玺洋,白俊杰,于凌云,梁旭方. 2012
[17]大口黑鲈组织蛋白酶B基因SNP筛选及其与生长性状关联分析. 李胜杰,周春龙,白俊杰,吴建开,樊佳佳,费志平,孙建国,马冬梅. 2018
[18]大菱鲆生长性状相关单核苷酸多态位点的多家系验证. 田涛,王伟继,陈再忠,胡玉龙,王陌桑,吕丁,李之乡. 2016
[19]三疣梭子蟹生长相关SNP位点的鉴定. 张德宁,吕建建,刘萍,冯艳艳,高保全,李健. 2015
[20]梭鲈快速生长品系F3基因型与生长性状关联分析. 潘亚丹,鲁翠云,孙志鹏,刘天奇,张渴新,郑先虎. 2024
作者其他论文 更多>>
-
两种养殖模式下罗氏沼虾肠道菌群结构、营养成分及肌肉风味比较
作者:刘明伟;魏捷;洪坤浩;王亚坤;刘付柏;朱新平;于凌云
关键词:罗氏沼虾;养殖模式;肠道菌群;游离氨基酸;微量元素
-
低眼巨鲶养殖群体的微卫星遗传多样性分析
作者:倪未;于凌云;李伟;陈海港;朱新平;刘晓莉;刘毅辉
关键词:低眼巨鲶;养殖群体;微卫星;遗传多样性
-
巴沙鱼低眼巨鲶胚胎和仔稚鱼发育观察及其生长模型的确定
作者:倪未;陈海港;刘晓莉;于凌云;李伟;洪孝友;刘毅辉;朱新平
关键词:低眼巨鲶;胚胎发育;仔稚鱼;温度;生长
-
基于转录组测序的中华鳖SSR和SNP特征分析及性别标记筛选
作者:雷骆;祝骏贤;陈辰;王亚坤;刘晓莉;洪孝友;于凌云;魏成清;李伟;朱新平
关键词:中华鳖;转录组;SSR;SNP;性别相关标记
-
草鱼快长品系及池塘生态高效养殖技术集成示范(上)
作者:宋含茹;彭勇鳌;陈总会;赵长臣;李胜杰;陈昆慈;白俊杰;时宝平
关键词:
-
草鱼快长品系及池塘生态高效养殖技术集成示范(下)
作者:宋含茹;彭勇鳌;陈总会;赵长臣;李胜杰;陈昆慈;白俊杰;时宝平
关键词:
-
利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记
作者:孙雪;李胜杰;姜鹏;杜金星;周家辉;白俊杰
关键词:草鱼;转录组测序;差异表达基因;单核苷酸多态性;生长性状