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水稻分蘖数遗传位点挖掘与候选基因分析

文献类型: 中文期刊

作者: 姚林江 1 ; 梁文化 2 ; 陈涛 2 ; 朱镇 2 ; 赵庆勇 2 ; 李余生 2 ; 姚姝 2 ; 赵凌 2 ; 周丽慧 2 ; 赵春芳 2 ; 路凯 2 ; 王才林 2 ; 朱克明 1 ; 张亚东 1 ;

作者机构: 1.江苏大学生命科学学院

2.江苏省农业科学院粮食作物研究所/国家耐盐碱水稻技术创新中心华东中心

关键词: 水稻;分蘖数;Bin图谱;QTL定位

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2025 年 41 卷 008 期

页码: 1457-1465

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 分蘖数是水稻的一个重要农艺性状,直接影响水稻的产量。因此,挖掘水稻分蘖数相关基因,对分蘖数的遗传机制研究和品种改良具有重要意义。本研究利用分蘖数差异明显的粳稻TD70与籼稻Kasalath构建的186份重组自交系(RIL)材料,结合2021年和2023年的分蘖数和基因型数据,利用数量性状基因座(QTL) IciMapping V3.4软件,采用完备区间作图法对控制水稻分蘖数的QTL进行鉴定。2年共检测到17个分蘖数相关的QTL,分别位于1号、2号、4号、5号、6号、7号、11号、12号染色体上,对数概率比值(LOD值)为2.66~9.14,可解释表型变异为1.48%~8.68%;QTL定位物理区间分析结果表明,本研究中有3个QTL与前人定位到的分蘖数QTL区间重合或者邻近,其中2个位点鉴定出分蘖数基因。qTN2-1和qTN4在2年试验中均被检测到,表现出较强的稳定性,其中qTN2-1位于2号染色体上7.12~7.25 Mb区间内,2年的LOD值分别为3.96和7.14,贡献率分别为7.58%和6.45%;qTN4位于4号染色体上2.43~2.67 Mb区间内,2年的LOD值分别为3.94和2.66,贡献率分别为6.86%和8.42%。对qTN2-1和qTN4定位区间进行亲本间序列的变异分析,发现6个基因编码区在亲本间存在错义突变。进一步根据单核苷酸多态性(SNP)的类型将RIL群体株系分成HapA和HapB 2种等位型,效应分析结果显示,不同等位型分蘖数差异显著或极显著;结合表达分析结果发现2个分蘖数相关的候选基因,为进一步解析水稻分蘖数的分子机制提供了理论依据,并为水稻高产育种提供了新位点。

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