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猪流行性腹泻病毒检测与S蛋白中和抗原表位基因分析

文献类型: 中文期刊

作者: 丁卫星 1 ; 王荣谈 1 ; 郭佳宏 2 ; 廖学文 2 ; 缪德年 2 ;

作者机构: 1.上海瑞丰农业科技有限公司

2.上海市农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 猪流行性腹泻病毒;S蛋白;进化树

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2016 年 01 期

页码: 19-22

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 应用RT-PCR对2015年江苏、安徽、山东9个猪场的腹泻样品(新鲜粪便、肠道组织等)进行PEDV和TGV检测,并对检测到的一株PEDV(CHNJPK2015)的纤突蛋白中和抗原表位基因进行克隆测序和遗传进化分析。结果表明:9个猪场PEDV检测阳性率为100%,PEDV个体阳性率为63.89%,TGEV均未检出,说明本次流行的仔猪腹泻病主要是由PEDV感染引起的。所测毒株与参考毒株可分为3个群,CHNJPK2015株与AVCT12、Br1/87、CHM2013、LZC、SM98等毒株的S蛋白中和抗原表位基因的遗传距离较近,核苷酸序列同源性达99.5%—99.8%,处于同一群;而与2014年中国各地分离的CH/GDZQ/2014、FJ-FQ 2014、FJ-ZP 2014、PEDV-LY、PEDV-WS、PZ1406、SC1402、SH1404和疫苗株CV777序列的遗传距离较远,核苷酸序列同源性为92.9%—96.2%,处于不同的群。

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