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梅花鹿天然Toll样受体9基因克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张立春 1 ; 王全凯 2 ; 曹阳 1 ; 赵雪 3 ; 李赵志 4 ; 王晓阳 1 ; 朴庆林 1 ; 金海国 1 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院畜牧分院

2.吉林省中韩动物科学研究院

3.延边大学农学院

4.吉林大学白求恩第一医院

关键词: 梅花鹿;Toll样受体9;克隆;序列分析

期刊名称: 中国兽医学报

ISSN: 1005-4545

年卷期: 2012 年 32 卷 09 期

页码: 1386-1391

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: Trizol法提取梅花鹿肝脏总RNA,采用ORF两端兼并引物,RT-PCR方法克隆梅花鹿天然Toll样受体9基因(TLR9)并进行系统的生物信息学分析。RT-PCR结果显示,梅花鹿TLR9基因的mRNA长4 043bp,含有800bp左右的5’UTR,完整ORF编码1 081个氨基酸(GenBank序列号为:HQ260632)。同源性分析显示梅花鹿TLR9基因编码区与其他物种高度同源,但5’UTR区存在基因结构的变异。功能结构域分析显示不同物种间TLR9结构域相对保守但也存在细微差别,结构域的差别导致梅花鹿TLR9蛋白胞外区马蹄形弧顶内侧空间结构由人类TLR9蛋白的弧形改变为梅花鹿TLR9蛋白的三角形。进化分析显示TLR9基因分子进化关系与物种间真实进化相一致。

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