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基于WGCNA分析挖掘大白菜叶柄黑点症发生相关基因

文献类型： 中文期刊

作者： 雷娟利 1 ; 赵彦婷 1 ; 岳智臣 1 ; 陶鹏 1 ; 李必元 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 大白菜;WGCNA;叶柄黑点症发生;相关基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 021 期

页码： 7138-7145

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大白菜叶柄黑点症是造成大白菜商品性降低的一种生理性病害，本研究是为了明确大白菜叶柄黑点症发生的分子机制。以抗大白菜叶柄黑点症品系(韩春娃C8-1)和感叶柄黑点症品系(韩春娃-4-2-3-4)为材料，通过正常N和高N水平水培处理，处理前和处理后7 d及14 d分别取样，进行转录组测序和加权基因共表达网络分析(WGCNA)分析，挖掘与大白菜叶柄黑点症发生相关的基因。本研究共对30个样品进行转录组测序，获得201.58 Gb Clean Data。通过WGCNA分析，抗性品系3个模块与N水平相关性绝对值均小于0.5，因此没有获得与N水平相关的模块；而感性品系共获得6个模块，其中1个与N水平相关的模块(相关性绝对值为0.69)。此模块共包含48个基因，涉及17个KEGG代谢通路。大白菜叶柄黑点症发生相关基因的挖掘，为研究大白菜叶柄黑点症发生的分子机制提供了理论基础和依据。

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