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南瓜果胶含量的全基因组关联分析与候选基因预测

文献类型： 中文期刊

作者： 陶鹏 1 ; 丁小雅 1 ; 岳智臣 1 ; 赵彦婷 1 ; 雷娟利 1 ; 胡齐赞 1 ; 臧运祥 2 ; 李必元 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

2.浙江农林大学园艺科学学院

关键词： 南瓜;果胶;全基因组关联分析;基因;糖代谢

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2025 年 37 卷 006 期

页码： 1244-1251

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究南瓜果胶含量的遗传调控机制，挖掘关键基因，为南瓜口感品质的遗传改良提供理论依据，该研究采用硫酸-咔唑比色法测定208份南瓜种质资源果肉的果胶含量，利用果胶含量数据与重测序获得的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS),对显著关联区间进行候选基因筛选与功能注释。结果显示，南瓜果胶含量呈正态分布，在南瓜2、4、12、20号染色体上共获得了21个与南瓜果胶含量显著关联的SNP位点，其中有13个位于2号染色体8330664～8436445区间。筛选获得40个候选基因，其中3个基因(基因号为CmoCh02G014160、CmoCh02G014170、CmoCh02G014260)涉及糖代谢通路。这3个候选基因在南瓜种质资源中存在着大量的SNP和InDel变异，并且在南瓜果实中均有表达，可能参与南瓜果实中果胶的合成。该研究结果可以为优化南瓜果胶含量，改良南瓜品质提供新的标记与候选基因。

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