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鲫血清转铁蛋白cDNA克隆及系统发育进化序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 龙华 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院长江水产研究所农业部淡水鱼类种质资源与生物技术重点实验室

关键词: 鲫;转铁蛋白cDNA;克隆;系统发育

期刊名称: 水产学报

ISSN: 1000-0615

年卷期: 2004 年 28 卷 03 期

页码: 27-31

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 鱼类血清转铁蛋白是鱼类血清中一种非血红素结合铁的β-球蛋白。从GenBank数据库查询发表的鱼类转铁蛋白cDNA或基因序列,根据铁离子结合及转运功能位点,设计并合成了两对引物P1、P4以及P2、P3,克隆出鲫血清转铁蛋白cDNA中的核心片段,长度为866bp。再根据克隆出的核心片段分别设计上游及下游两对引物P5、P6以及P7、P8,随后用RACE方法分别克隆出鲫血清转铁蛋白cDNA的5'端(787bp)和3'端(1081bp)以及全长cDNA,最后在计算机上排列出鲫血清转铁蛋白全长cDNA,长度为2444bp。比较了14种鱼血清转铁蛋白cDNA序列的同源性,其同源性在30%~80%之间,结果显示鲤科鱼类(鲫、银鲫、鲤及斑马鱼等)具有很近的亲缘关系;同时进行了系统发育进化分析,证实了鱼类血清转铁蛋白进化的保守性和氨基酸序列的高度同源性。

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